Basic Information
Symbol
hsa_ASTN1_0009700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ASTN1_0103
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:177098978-177101054
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:177129842-177131918
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-549.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-591.75 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
596.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....((((((((((......((((.((((((((((((((((.((((..((((((((............((.(((.(((...(((((.(((((......)))))..)))))...)))))).))(((.(((......))).))).(((...(((((((((((((((......((((......(((((((............((((((....)))))).((((((...........)))))).(((.(.(((((((((((((.(((((((.........(((...))).........)))))))))))(((((((.(((((....((((........))))...))))).)))))))......................(((((((((.((.(((((((......((((..(((.(((.((.(((((((....))))))))).)))))).)))).(((((......)))))....((((((......)))))).............((((((((........))))))))..(((((....)))))....))))))).)).)))))))))((..((((((((.((((((.((.......)).)))))).(((((((.....((((((((((((......))..((((.....))))))))))))))......))))))).....)))))))))).....((((((.((((.........))))..))))))..))))))))).).))).........(((((.....))))).)))))))..((((.((((.((....))..)))).))))..........((((((.((((.(((......)))........(((((.((((((((.((((((((((((..((((((((((((((..(((((((((((((.(((.((((...)))).))).)))))...))))))))((((..(((((....)))))......))))............(((((((.....))))))).....)))))))))...)))))..)))...........(((((.......))))))))).))))).(((((........)))))..))))))))))))).((((..(((((...))))).....))))....(((....))).(((((...(((...........))))))))....((((((.(.(((((((..((((((((..((((.((.((((......).))).)).))))))))))))..))).))))).)))))))))).))))))...))))...)))))))))))..))))..))).....))).))))).....))))...((.(((..(((......)))..)))))......((((....))))))))).....)))))))...(((((((............)))))))((((((.((.((((..(((((((.(.((((.......((((.(((.....)))))))...))))).)))))))....)))).)).)))))).......((((((..(((((((........)))))))))))))(((.(((((((((..(((.....((......(((((((((((.........))))....))))))))).....)))..))))))..)))..)))...(((.((........)))))...(((((((......))))))).)))).))))..((((((((((((((.(((((..............((((((.((.(((((.((((((..((((....(((((((...(((.((......((......)).....)).)))..)))))))....))))...))))))))))).))))))))((((....))))....((((((.....)))))).........(((......)))))))).))))))))))))))....(((((......))))).((((..(((((...(((((((.(((((.(..(((((((....))))).....))..))))))...)))))))...)))))..))))....)))).))))))...))(((......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,,,.((((((((((......{(((.(((({{(((((((.{{.,.....{{{{{((({{,{{{{{{,,.((.(((.(((...(((((.(((((......)))))..)))))...)))))).)),((,((({..,.,|||,|||{(({..,((({((((((({(((..{{{(((((......|,|||,,.,..........((((((....)))))).((((((,..........}}}})}.|||,|,{((((((({((((.(((((((.........{{,...})).........)))))))))))(((((((.(((((....,(((......,.,,,,...))))).)))))))...........{,,,,,.....,,,,,,,,..,,..,||||},}...,{{{({{(({,{{{.(({(((,,,(,,..,,,,,,,},,)),)))}))||.{((((......))))}.,,.((((((......))))))..........,..((((((({,,,,....}}))))))|||||{{..,,)}}}},}}}}|},,,,.}|{|||,,,..{((..((((((((.((((({.{{.......)).}))))).(((((((.....((((((((({{,......}}.,((((.....))))))))))))))......))))))).....)))))))}))}....}}})},.,{(({,..,.,,.}}}}.}),}}))))))))))))}{|,|......,,,..{{{,{..,..)))))})}))}||..{{({.((((.((....))..)))),))}}....,,.,,.||||||,}}.,,|)|)),.,}||,||}}}}})||{||.{{{{{{{{.((((((((((((..((((((((({(((,((((((((({(({{{,(|||{(||...||||.|}},|||||{..||}},,....{{..,{(((....)))))}|..}}))))},,..,,,,...(((((((.....)))))))...,,))}})))))},})))))..)))...........(((((.......))))))))).))))).(((((........)))))..)))))))))))||.(((({{(((((,..}|||}.....)))},...|||}}}}),,..,{{{...{({.|,,...,||||||||,,,...{((((((.(.(((((((..((((((({..((((.((.((({......).})).)).))))})))))))..)))},)))).))))))}(((((........))))}..}))))))))))..}},.,,)}),....}},}))))),,,,........{{.(((.,(((......)))..)))},...}}}||||...,))))))))))).)))))))))...{(((((({,......,,..))))))}|{{(({.{(.((((,.(((((({.(.((({.......{(({,((({....}}))))).,,})))}.}))))))....)))).)).))))}),,,,,..{{{{{{,,{((((((.......,))))))}}))))){{{.(((((((((..(((.{.,.((......(((((((((((.,.......))))....))))))),,...}})))..))))))..)))..))}.,,({(.((........}}))},,.(((((((......))))))).)))).))}},.{(((((((((((((.(((((,{............((((((.((.(((({.((((((..{(((..,,(((({((...{((.,{{{,,.,{{......}},....}}.}})..)}})))),...})})..,))))))})))}.))))))))||||||..}})}|,..{(((((,....))))))....{{{{{{{...,}.,)))))))).)))))))))))))).|..,{{{{......})))}.((((..(((((...(((((((.(((((.(..(((((((....})))).....})..,)))))...)))))))...)))))..))))..,.)))),,))))).}.})(((......)))
Forensic Context
No forensic context available.