Basic Information
Symbol
hsa_ATRNL1_0003100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0092762
hsa_circATRNL1_005
hsa-ATRNL1_0036
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:116879949-116919975
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115120185-115160214
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-164.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-179.64 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
191.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(..((.((((.........)))).))..)..)))))(............(..(((((((((((((.((((((....(((..(((.....)))..))).....))))))......((((((...))))))((((((((((........))))))((((((....((..((((.((.....)).))))..))..(((((.((.((((((......)))))).)).)))))..(((.((.((.......)).)).)))((((((.((((((.........)))))).)))))).......(((((((...(((((((((((...((((....((((....))))......)))).)))))))))))..)))))))))))))..)))))))))))))))))..)...(((.((((.((((.....((((((((((...................(((......)))..(((((.(((.(((((...)))))))))))))...........((((......)))).((((((.(((((.((.(((((...))))).)).(((....))).......))))).)))))).........(((.(((.....))).))).))))))))))......))))))))))).(((((....(((((..((..((((....)))).))..)))))....)))))............)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({{(,.,,.||||.{{{{{{..|}||{,|{(({.,||,,{,,,.........{..(((((((((((((.{{{({{(({........{({{{{{{{,,{{,,..,,|,,,,}}.....((((({...}))))).{||||{{{{{{{,,,,.|,|||,,,,,|,,,,,}}}}))||,}},}}}}}}})))}..},,}(((((.((.((((((......)))))).)).)))))..(((.((,({,,,....)),)).)))((((((.{(((((.........)))))).)))))).......(((((((...(((((((((((,{{,.(({{,.{(({....)}))}})...)))..)))))))))))..)))))))}}}}},.,,,,.)))))))))))))..}..{(((.((({.((((.....((((((((((,,,......,,.|,{{,..{{{..,|||))|,.(((((.(((.(((({...)))))))))))))...........{{{|.,,,.,}}},,((((((.(((((.((.,((((...)))),.}}.(((....))).......))))).)))))).,,,,....(((.(((.....))).))).})))))))))......)))))))))))},,,.,.}}}||})}}},}}}||||}}}}).},.)))))|.,|{..{{........))..))..)
Forensic Context
No forensic context available.