Basic Information
Symbol
hsa_ATRNL1_0008600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0092769
hsa_circATRNL1_013
hsa-ATRNL1_0025
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:116919801-116975638
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115160040-115215880
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-169.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-184.97 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
180.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((...((((((((.((((((((..(((..((((((((((((((.........((((.....((((..((((((....((((......))))...)))))).)))).........))))..((((((((...........(((((.((((.......((.(.((((((....))))))..).))......)))))))))....))))))))((((....))))(((((.........)))))..((.(((((.((((.....)))).))))).)).)))))))))...........((((.(((((.(((((..((((((.............))))))..)))..(((((......))))).........))))))).)))).))))).))))))))))))))))))).))).)))).))).(.((.((((....(((((((.(((((((((.((((((((...)))).)))))))))))))....))))))).........(((((((.((((..(((..((((((.((..........)).)))))).)))....))))))))))).(((((......)))))............(((((((...(((((......((((........))))...)))))...))))))).(((((....((((((....)))))))))))))))...)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((,,(((,,.((((((({{((((((((..(((..((((((((((((((....,,....,(({.{((.,,..}}}.}))...}||{{((((((({...,({{{....,,}}..))))))))}},..{(((((((...........(((({.((((.......((.{.((((((....))))))..,.))......)))))))))....)))))))}((((,...,|||(.,{{,,,|||...}}}}}|,,{.{{{{{,{|||.....)))},))))},)),)))))))))...........((((.(((((.{(((,..((((((..,..........)))))){{{|,..(((((......))))).}}}}.,},,}))))).)))).))))).))))))))))))))))))}.||}{||||{}}}.,.,,,|||||...,((((((.(((((((({,((((((({...}))}.))))))))))))),,,,)))}}}},}||,....(((((((.((((..{{(,.((((((.((..........}).)))))).}))....))))))))))).{{{{{..,,,,))})).......,,{..{((((((.,.(((((.{{{..{((,....,,..},))}..)))))...))))))).||||.{,,.((((({....))))))}}}.}}}},.,,}},}
Forensic Context
No forensic context available.