Basic Information

Symbol
hsa_ATRNL1_0008700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0092770 hsa_circATRNL1_014 hsa-ATRNL1_0013
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:116919801-117001514 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115160040-115241725 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-205.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -223.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 219.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.