Basic Information

Symbol
hsa_ATRNL1_0018700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0092784 hsa_circATRNL1_029 hsa-ATRNL1_0043
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:117040865-117075246 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115281355-115315736 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-252.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -270.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 254.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((.....((((((..(((((......(((....)))......)))))(((((.....)))))....((...((((.(((((...((((((((....((((....((.(((((((...(((((((((((((......)))))).)))).....)))(((.((.((((((...(((...((((((((.((..((((.((..((((((.......)))).))..)).))))..((((.(((((((................))))))).)))).(((((......((((....))))......)))))........((((.(((....))).)))).........)))))))))))))...)))))).)).))).....(((((((....((((((....((((..(((((((((.......)))))))...))......))))((((..((((((((((........((((...((((((((..((((((..((((((((((...(((.....(((....)))......)))....)))))))))).......)))))).....((.(((((...)))))))..))))))))...))))..((((((.((((((.(((..((.....(((.....)))....))..))))))))))).))))(((((((.(((((...)))))..)))).))))))))).))))..)))).......(((((......)))))))))))...)))))))....)))))))))...))))......))))))))))))).))))...)))))))).((((...(((((((...)))))))))))...(((((((..........))))))).))))))))))))....((((((...))))))..........)).(((.(((......)).).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((...,,..({(,.{(({...{{{{{((,..,,|{|,......},}}(((((.....))))).{{,.......||,(((.((((((((((..,,,...{{,,,..((((((((({..(({((((((((((......))))))}}))),.,,,,(((({(((((,,,,..}}|,|,.||||||||{,{{..{{((,({,,{{({{{.....,,)))},}}..)),))})}}|{,(,{((((((................))))))),,}}}.{((((..,,..{(((....))))......))))},}}}},.}||||)||),,))))}})}.,.}}.....}))))))))).))){{{||{|...,)))))}....(((((((....((((((.,{{(,,,.}||(((((((.......))))))),||.|{.,,,{||||((((..((((((((((.,,.....((({...((((((((..{(((((..((((((((((...(((.....(((....)))......)))....)))))))))).......)))))).....{{.(((({...})))))}..)))))))).,.})))..((((((.((((((.(((..((,.,,.,{(...,}))),,,,}}..))))))))))).)))),|,||||.{|{{|...)))))..)})),},.))))))}})))..)))).......{||||,,,...})}})))))))...)))))))...(((((.......))))){(((((((.((((..{........,..)))))))))))}....((((((|...}))))))......}||}}}},....,}}..}))})),,.))))))))))))....((((((...))))))..........)).(((.(((......)).).))).
Forensic Context

No forensic context available.