Basic Information

Symbol
hsa_ATRNL1_0018800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0092785 hsa_circATRNL1_030 hsa-ATRNL1_0021
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:117040865-117093929 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115281355-115334419 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-292.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -311.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 304.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..(((...((((.....((((((.......)))).))....)))).....)))..)))((((....(((((((((((..(((..(((.((((((((((..((....(((((..(((((((...(((..((((((((((......)))))).))))..((((((((.(((((......))).)).))))))))......((((.((..((((((.......)))).))..)).))))..((((.(((((((................))))))).)))).(((((......((((....))))......))))).)))...)))..))))..)))))......)).....)))))))))).)))...)))....((((((..............(((....)))....(((((((((((((.......)))))))....((.((((((((((((..((((((((((........((((...((((((((..((((((..((((((((((...(((.....(((....)))......)))....)))))))))).......)))))).....((.(((((...)))))))..))))))))...))))..((((((.((((((.(((..((.....(((.....)))....))..))))))))))).))))(((((((.(((((...)))))..)))).))))))))).))))..))))........))))))))))....((((((((((.(((((....(((((.......)))))((((((((.((((..(........)..))))))))))))(((((...))))).((((((((......(((((((..........)))))))(((((((((........((((((...)))))).)))))))))...))))))))......(((((((..((((....))))))))))).((((..((((........))))))))))))).)))..........)))))))...(((((......)))))..)))))).......))))))........)))))))))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((..(((...((((.....((((((.......)))).))....)))}.....)))..)))((((....(((((((((((...,{{.(((,({{{((((((,,..,.,,{(..,..({(((((((,..({,((((((((((......))))))}}))).....,(((((((({({{{{,.,,|,|,.|{{{{|{{{.{{..{{((.({..{{((({.......)))).}}..)).)))),,{{,(,{((((((................))))))),,}}}.{((((..,,..((((....))))......))))}.}}},,.,||||}|||,,}}))},)),,.,,.....}))))))))),))){{,|}||,,.})}))),....,,,,{{{..,.(,,,,|}},.,.{{{{(((((((((.......))))))).,,.{{.{{{(((((((((..((((((((((.,,.....((({...((((((((..{(((((..((((((((((...(((.....(((....)))......)))....)))))))))).......)))))).....{{.(((({...})))))}..)))))))).,.})))..((((((.((((((.(((..((,.,,.,((...,}))),,,,}}..))))))))))).)))),{,{{||.{|{{{...)))))..)))),},.))))))}})))..))))........||||}}}},,,,,,|||||||{{{,||||||,,.{||||,,,....})))){{{{{{||,||||,,|.,,...,,|.,|||||}}}}|||({({(,,,|||},.((((((((......(((((((|......,,.}))))})((((({{{{........((((((...)))))).)))))))}).,,)))))))),.}}).(((((((,,{{{{....))}}))))))).((((..((((........})}}))))}}}}},)))..........}|}}}}}...{{{{{......))))).,))))}),.....|{|....}},..,..)))))))))))..))))
Forensic Context

No forensic context available.