Basic Information

Symbol
hsa_ATRNL1_0020100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0092788 hsa_circATRNL1_033 hsa-ATRNL1_0038
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:117059544-117093929 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115300034-115334419 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-215.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -228.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((...(((.((..(((((((((((.....(((..((((((..(((((((.(((...........................))).))))))).....)))))))))....))))))))))).((((((((((((..((((((((((........((((...((((((((..((((((..((((((((((...(((.....(((....)))......)))....)))))))))).......)))))).....((.(((((...)))))))..))))))))...))))..((((((.((((((.(((..((.....(((.....)))....))..))))))))))).))))(((((((.(((((...)))))..)))).))))))))).))))..))))........))))))))......((((((((((.(((((....(((((.......)))))((((((((.((((..(........)..))))))))))))(((((...))))).((((((((......(((((((..........)))))))(((((((((........((((((...)))))).)))))))))...))))))))......(((((((..((((....))))))))))).((((..((((........))))))))))))).)))..........)))))))...(((((......)))))...(((........)))....)).)))...))))....))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,..({,{({{(((({{(,,,..|||{||||,{{.....(((,{,{{{||}}|((({{(.,.,,|}}}}..............,,,....))),||}}},)}}.,{||||},}},..},)))))||||||,{((((({{((((..((((((((((........((({...((((((((..{(((((..((((((((((...(((.....(((....)))......)))....)))))))))).......)))))).....{{.(((((...})))))}..)))))))).,.})))..((((((.((((((.(((..((,.,,.,((...,}))),,,,}}..))))))))))).)))),{,((((.(((((...)))))..)))).},.))))))}})))..))))........||||}}},..,,,.((((((((((.((((({{,.(((((.......)))))((((((((.((((..{........,..))))))))))))(((((...))))).{(((((((......(((((((,.........)))))))(((((((((........((((((...)))))).)))))))))...)))))))}..}}},(((((((.,{{{{....))},))))))).((((..((((........))))))))))))).)))..........)))))))...(((((......)))))..,|||}},.....|||...,||},||,..)))))},.}))),,,.
Forensic Context

No forensic context available.