Basic Information
Symbol
hsa_ATRNL1_0021400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0092790
hsa_circATRNL1_035
hsa-ATRNL1_0044
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:117075028-117093929
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115315518-115334419
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-97.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-102.90 kcal/mol
Frequency:
0.0002
Diversity:
46.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........((((......))))((((((((((.(((((....(((((.......)))))((((((((.((((..(........)..))))))))))))(((((...))))).((((((((......(((((((..........)))))))(((((((((........((((((...)))))).)))))))))...))))))))......(((((((..((((....))))))))))).((((..((((........))))))))))))).)))..........)))))))..))(.((((....(((((..(((((((.....(((....))))))..))))..))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.......,((((......)))}((((((((((.(((((({{.(((((.......)))))((((((((.((((..{........,..))))))))))))(((((...))))).{(((((((......(((((((..........)))))))(((((((((........((((((...)))))).)))))))))...)))))))}..}}},(((((((.,{{{{....))},))))))).((((..((((........))))))))))))).)))..........)))))))..))(.((((....(((((.,(((((((.....{((....))))))..)))),.))))))))).)
Forensic Context
No forensic context available.