ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_ABCC1_0018400
Basic Information
Symbol
hsa_ABCC1_0018400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0008255
hsa_circABCC1_077
hsa-ABCC1_0012
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16200595-16205439
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16106738-16111582
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-116.20
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-121.48
kcal/mol
Frequency:
0.0002
Diversity:
68.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((.(((((((.((((((..((((((.((((((.((((((..(((.......((((.(.(((....))).)...))))..))).((((((((((.....(((((..((((((((((((...(((.((((((.((.((((...)))).)).))).)))...((......))))).)))).).)))))))..)))))......))))))))))((((((....))))))((((.(((((((..........))).))))...)))))))))).)))))).))....))))...))))))...((......)))))))))))((.(((((((...)))..))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((.(((((((.((((((..((((((.((((((.((((((..(((.......{{((.{.(((....))).}...)))).|)}}.{(((((((((,....(((((..((((((((((((...(((.((((((.((.((((...)))).)).))).))).,.||....,.,}))).)))).},)))))))..)))))...,,.)))))))))}(((({{....))))}|((((.((((({{.{{{....,})),,))))...)))))))))).)))))).))....))))...))))))...((......)))))))))))((.(((((((...)))..}))}..))
Forensic Context
No forensic context available.