Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0018600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038136 hsa_circABCC1_079
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16200595-16230501 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16106738-16136644 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-582.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -609.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 364.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.