Basic Information

Symbol
hsa_ATRNL1_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ATRNL1_0074
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:116879949-117059757 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115120185-115300247 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-602.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -649.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 699.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))(..(.((.......((((((((((..(((..(((((.............((((((((((((..((..(((((..(((..((((((...........(((((.(((.((((.((((((((((.((((((.......(((((((...(((.......)))..)))))))....((((((((((((.....(((((.((.((((((......)))))).)).)))))))))....)))))))).....((((((((((((.((((((.........)))))).)))))).......(((((((...(((((((((((...((((....((((....))))......)))).)))))))))))..)))))))((((((((((((..((((((.....((((((((.((((((.(((....((((.((.((.(((((..(..(((((((..(((......)))..(((((.(((.(((((...))))))))))))).........(((((..(((...(((((((((....(((((..(((...((((((((.((((((((..(((..((((((((((((((.........((((.....((((..((((((....((((......))))...)))))).)))).........))))..((((((((...........(((((.((((.......((.(.((((((....))))))..).))......)))))))))....))))))))((((....))))(((((.........)))))..((.(((((.((((.....)))).))))).)).)))))))))...........((((.(((((.(((((..((((((.............))))))..)))..(((((......))))).........))))))).)))).))))).))))))))))))))))))).)))((((((........))))))...(((((((.(((((((((.((((((((...)))).)))))))))))))....))))))).)))))...(((((((.((((..(((..((((((.((..........)).)))))).)))....))))))))))).(((((......)))))(((((((((..........)))).)))))(((((((((...((.((.((((((.(((.(((((((((.(((((((((((((..((((((.(((((........))))).)..)))))..))))....(((..(((..((.....((((((((((((((....((((.((((...((.(((((..(((.(......)))).))))))).))))))))..))))))((((.(((((....(((((......)))))...)))))...))))..)))))))).....))..)))..)))........(((((.((((..........))))))))).....))))))))).)))))))))....(((((((((.....((.((((((.................)))))).)))))))))))(((((((.(((((....)))))..)))))))..........((((((.(((...))).))))))...........)))...)))))).))((((((((((.......))))))))))))...)))))))))....((((((((.((((.((((....))))))))...)))).)))))))))))))..)))..)))))......((((...(((((.((........)))))))..)))).........))))))).)..))))).)).)).)))).....((((.......)))).))))))))).))).......(((((.....))))))))))...))))))........))))).))))))).........)))))).....))))))))).))))))))))).))).))))).((((((((.(((((......))).)).))))))))......((((.((..((((((.......)))).))..)).))))..((((.(((((((................))))))).)))).(((((......((((....))))......))))).......((((...((((..(((((((((((.....(((..((((((..(((((((.(((...........................))).))))))).....)))))))))....)))))))))))..))))..)))))))))).)))..))))).)))))))).....)))))).)))))..)))))))..))))))......)).)..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.....)))(..(.((...(({.((((((((((..,((..(((((.............((((((,,((({,,((,.{((((.,(((..((((((.{{,{{{{{,,((((({{((,{{,.((((((...|))))),,{,((((((...,....}))}}},.....||,.{((((.((((((((((((((.{..{(((((((((.((.((((((......)))))).)).)))))..(((.({,({,,,....}),}).)))((((((.{(((((.........)))))}.)))))).......(((((((...(((((((((((,{{,.(({{,.{(({....)}))}})...)))..)))))))))))..))))))),,.((((...((((((((((...,,(((((((({.,,....(((....,{({..({{((((,(({{{{{((((((...((({{{{{{||{{{(((((.(((.(((({...)))))))))))))..........,,,,}}||,.,}.|}}}}|||.{{.(((((({(((...{(((((({{((((((((..(((..((((((((((((((....,,....,(({.{((.,,..}}}.}))...}||{{((((((({...,({{{....,,}}..))))))))}},..{(((((((...........(((({.((((.......((.{.((((((....))))))..,.))......)))))))))....)))))))}((((,...,|||(,,{{,,,|||...}}}}}|,,{.{{{{{,{|||.....)))},))))},)),)))))))))...........((((.(((((.{(((,..((((((..,..........)))))){{{|,..(((((......))))).}}}}.,},,}))))).)))).))))).))))))))))))))))))).}}}.}}}}.))).)}..))))))}.}|||||||,(((((((({,(((((({{...}})}.)))))))))))))}}}}))}})}}.})),,.,,.)}))|,}))||,...})))))))))...)))}.}))}).,.))))))))...)))))).)))))..(((((......)))))......,,,{..{((((((.,.(((((.{((,,((({....||..},))|..))))).,.})))))}.}}}||{,,{((((..{{{{{|.(((((........))))).}..}}}}}..}}})}..,{(((((((((((...{{,,(({({{({.(((((((((..(((((((.(((.....((((((((....{(((.((((((((((.{...((((....((.((({.(((,....(((((......)))))..,(((((..({{((((.((.(((...............)))..)).))))))..))))))}))..)))).)))))).}.))).)))))))..)))).,.{(((((((,,.((((({{......{.{,.,.}}}....,},,},}}}))))))),,))))))))..))).)))}}}))..)))))))))).}}},...}}}),,))|(((((.((,...}||,}||}},.....,.,|||{{|,..,,||{|{{.((((((((((.......)))))))))){{,...))),,)))}},.{{{(((({,((((,({{{...,||||||||,.,||}}.|||||{||,||{{{.|||..,}})}..}|}|||}|,.(((((((.((((,,((..((({.,.,.{,.....).,,.)))).....))))))).....))))))}..,,{|||,,,,,..})},))).,}})))}})}..,,,.,(((((.....)))))||||,....,.}}},,,.,,||||||||}}}}},}}||..,..{((({(({{{..({||{((((((({......)))))),))))|.,,,{(((({(((((..,...}}}.}}.|||||}||{,{,..,{((,({,,{{({{{.....,,)))},}}..)),))}),,|{,(,{((((((................))))))),,}}}.{((((..,,..{(((....))))......))))},}}}},.}|||}).,)}})))),})},,.||.....|||||}}}})|))}{(({{({....)))))}.............,,.,}}})))},,..)))))))))))),}}}},,}})))))))}}}},,}})}},.,}})))})),)))..}||}}...)))),,..,..)))))).)))))..)}}))))..)))))),}),..)).)..)
Forensic Context

No forensic context available.