Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0019200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038140 hsa_circABCC1_083
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16205232-16219768 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16111375-16125911 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-347.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -364.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 302.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((...((((((..((............))..)).))))..))).))(((((((.((((..(((((((((((.(((((..((.((.((((.((..((((.((((...))))...))))....(((.((((....)))))))..)))))).)))).))))).))))(.((((((((((((...(((((((((((((.........(((((.(..(((..((((..(...((((.((((.(((.((((((((((.(((....(((((((.(.(.(((((....((((((........))))))...)))))((((((((.((((((..(.((((.(....))))).)..))))))....))))))))).).)))))))...))).))))))(.(((.(((((((((((...(((((.....)))))))))).))))))))).)........)))).))).)))).)))).)..)))).)))))))))(((....)))...............)))))).)))))))...((((.((....)).))))...))).))).)))))).)((((.((((.(((((.....((((((((....((((((....))))))...(.((((((((((..(.((...((((.(((..((........))((((((((..(((((..((((....((((((((((((..(((((((.((.(((....))).)).(((.((((..((((((..((((((((...(((..........)))))))).....))).....)))))))))).)))...)))))))..)))))))))).))....))))..))))).))))))))..))).))))..)).)..)))))))))).)...)))))))).............))))).)))).))))..))))......)))..)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((...((((((..{{.....,.,....)).,)}.))))..))).))((((((,{((((..((((((({..({((((...((.((((,,,({.{.((({{(((.......((((((((....(((,((((....)))))))....(((((..{,......}...))))))))))))).....))))))).,),))....)))).)),..,||||}}..|((((.((((((((((({(((((,(((,((((,..,,,..}}|},|||.,{,{,,||{(|..{((({{{.,,,,.,,))))),,,{({{{{(((.((((,((,,,({{(.((.,.({{{.|,|||.|..||||{..{{{|,,,,,,)))).,.))))).,.))).),)))))).)))),}))}}}.))))))))}{..{{.((((((.((...(((((((((((..,......|(((((....((((((((((((.,.{{..............(((((..(((..(((,,((((((((((({{,....||||,|({{{{(((|||||..}||},,,{{{.{{{...,)))}}|,,,(((({..,............}))}}.})))))))){(((.((((((({{{{{,|{{{{{.{{.,,,),})))}........))))))))))}...))))))))))..)))))))).,.(((.(((((..((((((((.{.....}.))))))))..))))).)}),,.(((((.,.(((......,},.,)})))))}}...)))))))}..((((((.((((......)))))))))),))))...)))))}....,..,..)))))).))))).,.)))))))).))..},{((((({...))))))},||}...},,....,,})))))))))).))),}))))),.....)))..)))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.