Basic Information

Symbol
hsa_chr10_0112200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ATRNL1_0131
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
10:116881558-117001461 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115121794-115241672 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-233.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -259.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 307.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((......))))))))((.............(((((...((......)).)))))..((((((....(((.....)))....)))))).((((((....(((((((((.............................(((((.((.(((((..((((((((((((((......(((((........))))).............((((((......))))))............((((((((((........(((((((...((((.((((((((((.((((((((((((.(((((..((((((..(((((....))))).))))......((.((((((((.............................)))))))).)).((((((((((((..(((((...)))))..............((((.(((((......)))))...))))..((((((((.........((((.......))))..((((.((.....))...))))........)))))))).(((((...(((((((((((....(((((((.((((......))))((((...)))).(((((((......))))))).....)))))))...)))))..)))))).))))).......((((.((((......................(((...........))).....(((((..((((.((((((..(((.....)))......)))))).))))..)))))..........)))))))).))))).))))))).....))..)))))...)))))..))))((((.(((...........))).))))((((((((.......))))))))....(((......)))..(((.(.((((.................)))).).)))..........)))))).))))))).))))...))))))).)).))))))))............))))).)))))))))))))).)).)))))..(((...((((((...................))))))..)))....((((.(((.((((......((.(((....))).))....)))).))).))))..((((......))))..........))))))).)).))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({{.....,||}}}}}}{{.........,,,.{{{((...{{.....,...,}}||||,|{{{{|,,,|{{.....}))))))|{||,..((((({....{{(((((((...................}.........(((((.((.(((((..((((((((((((((......(((((........)))))....{........{(((((......)))))}............(((((((({{........(((((((...((((.((((((((((,(({((((((((({((((({{(.((((.,(((({....))))}.)))).,}},.,,.((((((((.....{.......................)))))))).|}.((((((((((((.,((((,,,,||}||.,.,({{(,,,{,.((((.(((((......)))))...))))..{{{{,,{({,...,,,.|,}}...,.}}||,||||}.,........}},,.,,{,,,,{,(,,||,,,|||.,((({{{,((,(({,,,,,..}},||||||}||,,,,},,.))))|{((|,.,}}}.{((((((......))))))}....,||,||||{{,|.,,.,,)))))).,,,}}.....,,{,{{,||{.....,},,..............{(({{,,,......}}}.....|{|||}}||||,{(((((..{{{.,,,.})).,....)))))).}})}..))))),,,.,}}},.},}},.)).)))))},))))))..,..,,..,,}},...|||||....,,.|||}}|,...........,,,.{(((((((((((.......)))))))}})))|{{|..,,})))....},,..}||}}}}}},...,.......,,,...}}...,,,,....}}}}}}.))))))).))))...))))))).}}}))))))))........,...)))))},))))))))))))).)).)))))..,,{...{(((((......{,....,......))))))..},,....,((({{,,.,|||,,.{{{,({{((....,,,,)},}.})),,.|||,,|},|.((((......)))).,..,.,},,))))))).}}.)))))),,))
Forensic Context

No forensic context available.