Basic Information

Symbol
hsa_ATRNL1_0010200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ATRNL1_0090
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:116930795-117027921 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115171037-115268444 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-251.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -272.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 213.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.