Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0019600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038144 hsa_circABCC1_087 hsa-ABCC1_0053
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16208623-16219768 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16114766-16125911 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-276.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -289.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 248.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(..(((..((((..(...((((.((((.(((.((((((((((.(((....(((((((.(.(.(((((....((((((........))))))...)))))((((((((.((((((..(.((((.(....))))).)..))))))....))))))))).).)))))))...))).))))))(.(((.(((((((((((...(((((.....)))))))))).))))))))).)........)))).))).)))).)))).)..)))).))))))))(.((((((((((((.(((((........((((.((((((((((((....(((((((((((......))...(((.(((....))))))...(((((...............))))).)))))))))((((.(((((((((((((((........)))).)))).........)))))))))))....((((((....(((...(((((((((.(((((..((((((((.(.....).))))))))..))))).))).))))))..)))..))))))...(((((((.......))))))).(.((((((.((((......)))))))))).)(((((..(((((.......))))).))))).)))))))...)))))..))))(((((((...)))))))..((..((.......))..)))))))))))).))))).....((((...))))...)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.{..(((..((((..,.,.((((.((((.(((.((((((((((.(((..{,(((((((.(.{.(((((...,((((((........)))))},..)))))((((((((.((((((..{.((((.(....))))).)..)))))},...))))))))).).)))))))}..))).))))))(.(((.(((((((((((,..(((({..,,.))}})))))).))))))))).)........)))).))).)))).)))).}..)))).))),))))(.(({(((((((((.(((((,,({,((.({{({((({((,{{(((((.{(.,..||,|||||,||{|||||{{|.||{..,{|||||{{,{((({,..,,.,........,,)}||.,}}}}))))||||}|{{{{{(|||{{,}|||||,{{.||.}|})))}.,,,.,..},||||||||..|{||||,{(({{{,{(,,{(((((((({.(((((,,{(((((({.,...,,},)|||}|||,.}||||,|}}{||||||,.},|{{..,,,,,,,.,)}))))}.,...)))||||,}}||||||,|{|||...}}))))),.)))|}|||||,}{{{{{}}}}..}))))},))))))))}}))},.,)}}}},}}}))||||||{,.,})))))),|||...|},....,),))}})))))))))),))))),,,,.{{{|,..))))}..)).)
Forensic Context

No forensic context available.