Basic Information
Symbol
hsa_ABCC1_0020000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0105082
hsa_circABCC1_089
hsa-ABCC1_0023
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16215832-16230501
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16121975-16136644
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-333.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-349.84 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
271.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(.((.(((((((..(((.((....)))))..)))..(((((((.((((((((((....((.(........).))....))))))).((((.(((((((((((((((........)))).)))).........)))))))))))....((((((....(((...(((((((((.(((((..((((((((.(.....).))))))))..))))).))).))))))..)))..)))))).(.(((((((.......))))))).).((((((.((((......)))))))))).((((.(((((((.((((((((.(((..((((.(((((..(.(((..((((((.(((((((...))))))).)))...)))...))).)..)))))...))))))).)))))...))).))))))).((((..(((((((.....))))).).)..))))))))))).))))))).((((((((((((((((..........)))))......(((.((.((.(((((((((((((.(((...((((......))))........(((((((((...(((..(.(((.(((((((((((((..(.((((.....)))).)..))))(((....((((......))))...)))..(((...((((.....(((((.......)))))....))))..)))........))))))))).))))))).)).)))))))(((.((((.........)))).))).(((((.((...(((((....)))))....)).))))).))))))))))))..))))))))))))))))))))))..(.(((((((((((((............))).)).)))))).)).).)))).)).).)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({.{.((,((((,,,,,(((.(({{..|||||{{,..{{(({{{{||,{(((,(((((,.,,.{(((((({..{,({({{(,{{{||||||{.{({{,(((((,,,.}|}||({(((((.(({|,|{.{{{{({.,.{||,,|||..||||||.|((({{{((..,(((((((({.(((((,.{(((((((.,.....},)|||}|||,.}}||},|}},}}||})..})},,..}}}}},,.,))}))))}}}}}))).}}}})))))}||}|,|||,,.|}|||||{.||||||||||{|{{{{,||||,,||}|||,}|}||}||{||,.|.||{.,|||,|}}|||||||}.,,}}))))})))...},,...,,}.)}})),))}).)))),,..||,,,...,,,}))))),,.,|||}}}|(((((.....))))).}.}.,))))}}|}}|),)))))}..(((((((((({{((((....,,,...}}}}}......(((.((.((.(((((((((((((.(((...((((......))))........((((((({{...(((.,{.(((.(((((((((((((.,(.((((.....)))).)..)))}(((....((((......)))),..)))..{((...((((.....(((((.......)))))....))))..))}.,....,.))))))))).))))))).)}.)))))))((({((,{.........,)))}))}.(((((.{{...((((,....,,}})}}}})}.))))).))})))))))))..)))))))))))}))))))))))..(,{(({{{(((((({.....,,,,,,.}}}.)}}}})))).)).}.)))).)),),)))))))...
Forensic Context
No forensic context available.