Basic Information

Symbol
hsa_ATRNL1_0016900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ATRNL1_0220
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:117027803-117093929 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115268326-115334419 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-331.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -353.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 350.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((.((((....))))))))...)))).((((((..(((((.((((((.......(((((.(((.(((((((.(((((.((..((((.(((........).)).)))).....))))))).....)))))))........(((((......(((....)))......)))))(((((.....))))).(((.......)))(((.((((((((((..((....(((((..(((((((...(((..((((((((((......)))))).))))..((((((((.(((((......))).)).))))))))......((((.((..((((((.......)))).))..)).))))..((((.(((((((................))))))).)))).(((((......((((....))))......))))).)))...)))..))))..)))))......)).....)))))))))).)))((((.((....)))))).............(((....)))....(((((((((((((.......)))))))....((.((((((((((((..((((((((((........((((...((((((((..((((((..((((((((((...(((.....(((....)))......)))....)))))))))).......)))))).....((.(((((...)))))))..))))))))...))))..((((((.((((((.(((..((.....(((.....)))....))..))))))))))).))))(((((((.(((((...)))))..)))).))))))))).))))..))))........))))))))))....((((((((((.(((((....(((((.......)))))((((((((.((((..(........)..))))))))))))(((((...))))).((((((((......(((((((..........)))))))(((((((((........((((((...)))))).)))))))))...))))))))......(((((((..((((....))))))))))).((((..((((........))))))))))))).)))..........)))))))...(((((......)))))..))))))......)))..))))).....)))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.((((.((((....))))))))...)))).((((((..(((((.((((((.......(((((.(({.(((((((.(((({,((..((((.,.{.,,.....),,,.)))).....))))))).....)))))))..,{{,,{{({{{..,||,({{,.,,|||,,.....}}}}{((((.....))))),{{,.......||.(((,({{{((((((,{..,.{{((.....({(((((((,..({,((((((((((......))))))}}))).....,((((({(({({{{{,.,,|{|,.|{(((|({{.{{..{(((.({..{{((({.......)))).}}..)).)))),,{{,(,{((((((................))))))),,}}}.{((((..,,..((((....))))......))))}.}}},..,||||,{{|..,,))),))}}.,,.....,))))))))),))),{,|}||}}.})})))}....{{{{{{{....({{{{|,},,{.{{,|||(((((((.......))))))),,,.{{.{{{{{({{((((..((((((((((.,,.....((({...((((((((..{(((((..((((((((((...(((.....(((....)))......)))....)))))))))).......)))))).....{{.(((({...})))))}..)))))))).,.})))..((((((.((((((.(((..((,.,,.,((...,}))),,,,}}..))))))))))).)))),|,||||.{|{{{...)))))..)})),},.))))))}})))..)))).......,||||}}},,,}},,|||||||,,,}|||||},,.{||||,,,....})))){{{{{{||,||||,,|,,,.,,|,|,,|||||}}}}|||({(,({{{|||},.{((({(((.,....(({{{((|......,,.}})))}}{((((||||,.......((((((...)))))).}))))))}).,,)))))))),.}}}.(((((((,,{{{{....))}}))))))).((((,,((((........})}}))))}}}}}}))).....,},,,)}}}}||...(((((......))))).,}))}}},.....}))..))))).....)))))))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.