Basic Information

Symbol
hsa_chr10_0113100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ATRNL1_0245
Host gene
ATRNL1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
10:117207770-117209192 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:115448260-115449682 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-404.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -434.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 338.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(.((((.(((((..(((......((((.((..(((((........)))))...)))))).((((((.(((((((((..((((....((((.(((((..(((((((((........)))))))))..((((.(((.((....)).)))..)))).......((((((.(.(.((((....))))).).)))))).((((((((((.((..((....)).)).))).)))))))..((((.((((((......(((((((((((((((((..(((((((((((((((.((((.((...(((((...((((((.(((.((((...(((.((......(((((...)))))....)))))...)))).))).)))))).)))))...)).)))).)))....)))))))))).))((((((((((((((.......((((.(((((((.((((((((.....)))(((..((((((...))))))..)))...)))))..))))))).))))..))))).))))...)))))..........(((.....)))...)))))))))))..))))))......))))))..))))))))).))))))))..))))))))).))))))...)))..))))))))).))(((((..(((...((.(((((((((....(((((.((((((((((......))))))......(((((((((((...((((((((((.((((((........)).....)))).(((((((....)))))))((((((((.(((((.......((((((.((((...(((((.((((.((((..(((((((((((.(((((.((......)).))))).)).))....))))..)))..)))).)))).)))))...))))..))))))..................(((((((........((((......)))).......)))))))....))))).))))))))..........((((((((((....(((...............)))....)))))))))).))))))))))......)))))))))))(((.((((..(((..(((((...((((((........(((((((...((((.....))))........................(..((((((((.(((((...))))).))))...))))..)............))))))).......))))))....)))))..)))....)))))))(((((((....(((((((.........((((((.((((......)))).......(((((......))))).)))))))))))))...)))))))((((((((..((....)).)))))))).......))))))))).....))))))))).)).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(.(((,{(((((..(({......((((.((..(((((........))))).,.)))))}.((((((.(((((((((..((((....((((.(((((..(((((((((........))))))))).,((((,{((.{{...,)),)))..}}},.......((((((.(.(.((((....))))).).)))))).((((((((((.((..({....)).)).))).)))))))..((((,((((((......(((((((((((((((((..,,{{(((((((((((.((((.((,{.(({((,..((((((,(((.(((,.,.(((.,,......((((,...,,,))}}..})))}..)))})}))}.)))))),)),))...)).)))).))),...))))))))}|,|,((((({((((((((....{,.((((.(((((((.(((((..,......||(({..((((((...)))))}.,)})}},)))))..))))))).)))).}))))))}}))...)))))...,,,....{{{.....)},...)))))))))))..))))))......)))))).}))))))))).))))))))..))))))))).))))))...}))..))))))))).))(((({.,{((...,{.(((((((((....{{{{{.((((((((((...)))))))))}.....,((((((((((...((((((((((,((,({.........)}}}.,||||},(((((((....)))))))}||||{({.(({((.,{{{,{(((,(({(,{{,{,((({{,{{({,((((,.((({((|{{||,{{{||.{{,.||,.||{|||||.||{|....))),)}})))},)))).)))).)))))}}.))))..)))))},,.......||||,,...{{{{{{{,|,,....{(({......})})...,,,,))),,},...,))))),)}}}|||......,,,,.((((((((((....(((,,.............)}),},,)))))))))).,)))))))))......))))))))))}{((.((((..(((..(((((...((((((........,,{{{{{.,.((((.....))))..,{{,..........,{{{..{,...((({((({.(((((...))))).))))..,})),.,)}}..........))))))}.......))))))....)))))..)))....))))))}{((((((..{{(((((((.........{(((((.((((......))))...||,,{{{{,......}}))),)))))))))))))}..))))))}((((((((..((....)).))))))))......,.|||}}}}}.,,,.))))))))).},.}}))))))
Forensic Context

No forensic context available.