Basic Information
Symbol
hsa_chr16_0038500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0116
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
16:16062140-16062811
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:15968283-15968954
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-224.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-234.17 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
237.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((..(((((((..(((((((((...(((((.................)))))....)))))))))..)))))))..)))))))))))(((((((.(((.((((((...(((((.((((((((...(((((((....))).))))((((.(((((......).))))))))..........((((((.((.((.(((....((((((((.(((........)))))))).)))))))).)).)))))).....((((((...)))))).(((((((((..((((((((((((((.....((((((.(((...))))))).))((((((...))))))))))).))))))....))).)))))))))....((((..((((.((.((((((((...........)))).)))).)).).)))...)))).))))))))..))))).(((((((((((((((.(((..((((............))))))).))))))(((..((((((.....))))))))).....................(((((..(((.(.....).)))..)))))...........)).))))))).........)))))).).)).))))))....((((...)))).((((..((((((....)))))).)))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((..(((((((..(((((((((.,,(((((.................))))).,,.)))))))))..)))))))..)))))))))))({({(((.((({((((((,..{{((({({{{(((,,{,(((({....((((((((((,,,,.,|||}}}}}}}|,|||,||)),|{{{{{,,{(((,,{,{{,((,(((.,,|||||{{{{.,,(,,,....,})}|}}}}.}||}},,,.,|,|||||||....||{{{{...}}}}||.,(((((((({.(((((({{{{{{{{,,..((((({....}))))){{{||{{{(({(((.,,||||||,||||,}|,|||.,..}}),)))))))),..,{((|....,,}}}}.((((((({...........}))).)))},,.,}}))}.},}))).))})))||.|||,,..|||||(({{,{{((({{{{..||||...}},,})}}))))),,,})))))|{||..{{||||,,,,,)))))))))}..............,.....,,|||,.|||}}}}}}.,.}}}}})}}},...........}),|)))})),........||||||.,.))}))))))}...||||}},)),,.{(({..(((({|....)))))).)))).)
Forensic Context
No forensic context available.