Basic Information

Symbol
hsa_ATXN10_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0008199 hsa_circATXN10_011 hsa-ATXN10_0012
Host gene
ATXN10
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:46085592-46136418 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:45689712-45740538 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-298.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -318.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 221.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((........(((((((..((((...)))))))))))..............((((.((..((((.((((.(((((((((((((((.((((((.(.((((((((((...((((.((.((((((....((((((((((((((((((.......)))))))....)))))))))))(((.(((((...((((((((((...(((((.....)))))...)))..))))))).))))).)))...)))))))).))))(((((....)))))(.(((((.(((((((((((((..((((((((((((((((.........(((((....)))))((((......((((((..........))))))))))(((((((((..............)))))))))...))))))))..((((..((((((..(.........)..))))))..))))....))))))))((((....))))....(((((((((((.(((...(((((...(((((((((.((((((((((((....)))).)))))....)))..((((((((((..((...((((.((((....))))...))))....))......)).)))))))).....((((((.......))))))..........(((((......)))))....(((........)))))))))))).)))))..))))))))))))))...((((.(.((.((((((((......)))....))))))).).)))).(((((((.......)))))))...)))))))..(((((........).)))).)))))).).)))).)...(((((...))))).......))))))))))))))...(((......)))))).)))).)))))))))))))))..))))..)).))))((((((((((.......))..))))))))((......))....(((.((((.....)))).)))..((((.......)))))))(.((.((((...(((..((((.((((.....)))).))))..))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({........((((((({.,((,...,))))))))))..............((((.((..((((.((((.(((((((((((((((.((((({{(.((((((((((.,.((((.((.((((((....((((((((((((((((((.......)))))))....)))))))))))(((.(((((.,,((((((,(((...(((((.....)))))...))),,}))))}}.))))).))),,.)))))))).))))|((({....,)}||{.(((((.(((((((((((((.,((((((((((((((((.,.......(((((....))))){{{{.....,((((((.,........))}}}}}},,{{(((((({.|.......,}.},)))))))}}...))))))))}.((((..((((((..{.........}..))))))..))))....,)))))))((((....))))....(((((((((((.(({..,(((((...(((((((({.(({{{{{{(({(,,,,|||||||}||....|||..(((((((({,..,,...((({.((((....)))).,,))))....}}|.....)),)))))))).....((((((.......))))))..........(((((......)))))....,(({{...}}}).}))))))))).))))).,))}))))))))))}...((((.{.((.((((({{{......})),...))))))).).)))).(((((((.......)))))))...)))))))..{{(({........).)))}.)))))).).)))).}}|,{{{((,,.)}})),}....,))))))))))}}})||||{,......}},))).))))))))))))))))))))..))))..)).)))){(((((((,{.......)}..)))))))|((......)),...(((.((((.....)))).))).,((((.......)))))))(.{{.((((...(((..((((.((((.....)))).))))..)))))))}))
Forensic Context

No forensic context available.