Basic Information

Symbol
hsa_ATXN10_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0001246 hsa_circATXN10_019 hsa-ATXN10_0003
Host gene
ATXN10
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:46096162-46136418 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:45700282-45740538 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-204.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -219.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 260.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)((((((((.(((((((..(((((....)))))...(((((....)))))(((((..(((((((((((...((.....(((((....)))))....))......)))))))))))...((((((.(((...((((..((((((..(.........)..))))))..))))............((((....))))....(((((((((((.(((...(((((...(((((((((.((((((((((((....)))).)))))....)))..((((((((((..((...((((.((((....))))...))))....))......)).)))))))).....((((((.......))))))..........(((((......)))))....(((........)))))))))))).)))))..))))))))))))))...((((.(.((.((((((((......)))....))))))).).)))).(((((((.......)))))))...))).)))))).......(((((.....)).)))...)))))........)))))))..))))))..(((((((......)))))))......((((((....((((((.(((.((.......)).))).))))))((((((((((.......))..))))))))((......))....(((.((((.....)))).))).(((((.......))))).))))))((((...(((..((((.((((.....)))).))))..))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....)(({(((((..(((((({(((((((((.,.......(((((....))))){{{{....,,((((((.,........))}|}}}},,,{{{(((({.|.......,},},)))))))}}...))))))))}.((((..((((((..{.........}..))))))..))))....,}))))))((((....)))).,,,{((,,...((((((({.,,(((((,.,,....,,{,(,{,,,((((((.,{{||||,,||||,.,.{||..(((((((({..{(({{.(({,.((((....)))),{{||,,....,,}|,,,.,},,,,||,||{...,}|,||{{{{{{..,{|(((((........(((((......)))))..{{,((({...}}}).))})}}}}}|.{(({.((({(({.,.{{(({..,,(({{.{.||.{{{{||||,.....,))},..))}}))).}.}}}}.(((((((.......))))))).,}}}}}},,..,}))},,,|,||||,}..})}))}...}.,}}}}},,}|||}}}}})},))))))}.|{|||||,,,},.))))),,,)))}}}}}||,.,,,||{{{{,|||.|,,,,,.,}}}.)}),)}}}},{(((((((,{.......)}..))))))))||,.,.}})))...,||}||||}..||})))|)))|(((((.......,},},}))))}.|||{..|(((..((((.((((.....)))).))))..))))))).))
Forensic Context

No forensic context available.