Basic Information
Symbol
hsa_ATXN10_0008500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0004647
hsa_circATXN10_028
hsa-ATXN10_0028
Host gene
ATXN10
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
22:46132848-46202902
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:45736968-45807022
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-527.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-571.81 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
563.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((((((((((((.((((..((.(((((((........))))))))).)))).)))((((((..(((......)))))))))..((((((.((((.(((((..(((((......)))))..))))).............)))).))))))((((.(((((..........)))))))))......(((((............(((((..(((..(((((.(((((..((((((.((((.((((.(......))))).............((((......(((((((......((((((....((((......))))))))))...)))))))......))))(((((.((((((((((((((....)))))))((.((((....)))).))))))))))))))..((((((......))))))((((..((((((((.......)))))))).))))(((.((((((((((.(((.......((((((((.......))))))))....................(((((((((..(((((((......(((((...((((((.........((((((((..((((((.((((((..(((((((...(((((.........)))))......)))))))..)))....))).)))))).))).)))))..(((........)))....)))))))))))......)))))))..)))))))))..................(((((((((..((((..((..(((((.(((((......))))).)).....))).))..)))).)))))))))))).)))))))))).))).....((((((..(....)..)))))).....)))).)))))).)).))))))))..)))...))))).............))))).............((((((((..(((((((((........)))))..))))....(((....)))(((((...(((((...(((((((....))).))))...........((((.((((.........)))))))))))))....)))))........(((((((((((((........)))))))))))))((((((((.(((((......))))).))))))))..))))))))..)))))))))).)).............(((((.....))))).........((((.(..((((((((.......((((..((((((((...(((...........))).))))))))..))))..((((.((((...((((..((((((((((((((((((.((..((((.((((((....((((....((((((((((((((..(((((((.(......((((..((.(((((((((......))))))))).))...)))).((((((((.(((....(((((.(......((((((....))))))(((((((((.......((((...........)))).....)))))))))....((((.((........)))))).((((((((((....))))))))))).)))))....))).))))))))..........((((((((((...(((.((............)).)))......))))).)))))).)))))))..)))..))))))))))).....))))((((((((.......)))))))).......((((((((((....)).))))))))..))))))))))((((((.((((......)))))))))).)).)))))))..)))))).))))).....))))..))))))))....(((((((......)))))))))))))))..))))).((((((.(((.((.......)).))).))))))((((((((((.......))..)))))))).....)))))((..(((.((((.....)))).)))((((((.....(((.((.((((((..(((..((((..((((.((((.....)))).))))..))))....)))..)))))).))))).....))))))......((...((((..((....))..))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((((((((((.(((((((({(((((((({{,,,,,.,{{{{|,,|,....,,|}..|{||||,.,,{|||||,}|||}||||{{((((((.((({.,,(({||(((((,....,))))}..}}}}|....,,.......)))),))))}}||,,.||}}}}}}},,..,,}}}}},|{(((((..(((((,{{,........(((((..(((..(((((.(((((..((((((.((((.{{(,,{..,.,,|,||,...||,,.,}.,,((((......(((((((......((((((,.,{((({....,,))))))))))...)))))))......))))(((((.((((((((((((((....))))))){(.{(((....)))}.)}))))))))))))..((((((......)))))){{{{.,{(((((((.,...,.)))))))),}}}}(((.((((((((((.{((.......((((((((.......))))))))................{(((((((((.{{{{..,{{,,,..,,,{{,{,.....{{{{|,,,..,,}|,||||{|||||||||,,{{(((..(((((((.{{(((((.........)))))..,,..)))))))..))},}}}||||||,|||.,...,,,,|,,,..,,.((((({(,,,,...,||||}},..}}}}},,)))}}.))))).,},,,,....,,})),})))},(((((((((..((((..((..(((((.(((((......))))).)).....))).))..)))).)))))))))}}}.)))))))))).)))....,({((((..(....}..)))))).....)))).)))))).)),})))))))..)))...))))).............))))),,,,{{..(((((((...(((((((,({,(((,.{{{{..,,)))).}.,},,..))..)))))))..))))))),,||,..,,.}}},.}}))))).}}}}....}}}.}}}||.((((,,....,},)}))}|,|{{{{{....})))))}}....{(((((((((((((........)))))))))))))|(((((((.(((((......))))).))))))))}))),.,)))).)))))))))).))}......{((.((((((((((..{{.((((((.,,...{(((((.(((((.{{,{{{...,|}|}.,||{.|,||,,,....,,,..(((((....((((((((((({....{,,..((((((((...((((((.(,((,...,)),..))))))..}))))))}..,}|((((((.{(((((....)))))}))))))))))))))))))))))),||||,||..,}}}),))))))},...)))))).}}.)))))))))).))}....}},},......((((.(((((({(((((((((({{,..,,.{({,...,}}|.,{{{{{,.,..|||||||,,,....((((({(,,.,{{,{,{,(({{(((((((((....)))))))))).)}}.,}}}}}}}}.)))).}}}...,,,..|||||({{{{{{..{((({((({..{,.........,}}......}))}|{|||||{{{.,,,......,,|}||,,,.,,,......,,,(((((((({..,,,,.}}}}}}}},......{{((((((((....))},))))))}............((((((.((({......}))))))))}.}}.}},))))}},))))))))))))}..{{|||,..}}})),|.,,.(((((((......))))))),)})})))))......((((((.(((.({......,)).))).))))))((((((((,{.......)}..))))))))..,,.,)))))))))},))}}}.)))))))))).(((((((.....(((.((.((((((..(((..((((..((((.((((.....)))).))))..))))....)))..)))))).))))).....))))))).....{|...((((..,{..,,)),.)))}...,,,)
Forensic Context
No forensic context available.