ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_ATXN10_0010700
Basic Information
Symbol
hsa_ATXN10_0010700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116782
hsa_circATXN10_032
hsa-ATXN10_0018
Host gene
ATXN10
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
22:46189179-46202902
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:45793299-45807022
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-133.40
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-141.65
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
66.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((.....)))((((((.(((.(((((((....))))).)).)))...(((((((((((..((((((((........((((................))))..)))).))))..))))))..........((((..(((.((((((((((....((....(((((.(((((......))))))))))....))....))))))))))..(((((...)))))......(((........)))..(((((((((.......(((((....(((((....((((.(((.((((((((.((((((.(((((((..((...((((........))))...))..)))...)))).)))))).))))))...))...))).)))).)))))....)))))((((.....))))((((......)))).....))))))))).)))..)))).....((((((.((........)).)))))))))))..((.(((.((((...)))).))).)).)))))).((((..((....))..)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
{((...,.}}}((((((.(((.(((((((....))))).)).)))...(((((((((((..((((((((......,.((((................)))).,))))}}}))..))))))..........((((..(({.((((((((((....{{....(((((.(((((......))))))))))....}}....)))))))))}..(((((...)))))......{{{........}}}..(((((((((.......(((((....(((((....(((({((({,{((((((.((((((.(((((((..((...((((........))))...))..)))...)))).)))))).))))))...,)}.})}}.}))}.)))))....)))))((((.....))))((((......)))).....))))))))).}))..)))).....((((((.((.,......)).)))))))))))..,{.{{{,|({|.,.,}}).))).}),)))))).((((..((....))..)))).......
Forensic Context
No forensic context available.