Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0001200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0134
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
16:16082664-16083876 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:15988807-15990019 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-478.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -497.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 299.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((..((((....)))))))))(((....(((((.........((((.....(((((....))))).))))......(((..((((((..(((((...................)))))..))).))).))).)))))(((((((.(((((((.(((((((((((((..(((((.(((((((((((((((...((((((((.((((........(((.......(((((((((..((.(((((((..(((((..((((((((.(((((.(((.(((((.((((((((....(((((.(((((....))))).)))))...(((((.((((....(((((.(((((((.((((.((((.(((.(((.((((..((((...(((((((((.(((((...(.(((((...(((((((.((((......(((((........)))))......)))))))))))((.((((......)))).))..((((((((..(((((......)))))..)).))))))..))))).)....)))))))))).)).))....).)))..))))..)))))))))).)))).)))).)))...(((((...((((((((..(((..........))).))))))))))))))))))((.((((........)))).))....(((((((((((..(((((.((((((.......)).))))..)))))......................))))))))))).........((((.(.((((((((((((...)))))))))))).))))).......)))).))))).....(((((.((((((((...((((...((((((...(((((((.((((........(((((...))))).))))))))))).((..((((.((.((((((....((((((((((((((..((.....)).))))))....))))............)))).....)))))).)).))))..)).))))))...)))).))))(((..(.(((.....))).)..)))..)))).))))))))))))).))))).))).))))).))))))))..)))))..))))))).))..))))))))).......)))........)))).))))))))...))))))))))))))).)))))..))))))))))))).))))))).))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((..(((,....}))))))))((({{{,{(,{,.,{.,,,,,{||||||,.{{{((..,{||||,.||||..,...{{,..||||{{..{((((...................)))))..))),))).))).)}|,((((((((.(((((((.(((((((((((((..(((((.(((((((((((((((...((((((((.((((.....,,.(((.......(((((((((..((.(((((((..(((((..((((((((.(((((.(((.(((((.((((((((....(((({.,(((({{{{|||||{{||||,,,(((,(.((((...,{.(((.(((((((.((((.((({{(((.(((.((((..((({,..{{{((((((.(((((...(.(((((...(((((({.((({..,,|.(((((........))))).,..,,)))}))))))}((.((((......)))).))..((((((((..(((({......}))))..)),})))))..))))).}....)))))))))),}}.)),...),}}),.))))..)))))))))).)))).)))).)))..}}}.,},}}}}.||||}||,....,},||||,|||{|((({,..,{{{{{|.,,{{.((((........}))).},....(((((((((((.{(,(((.((((((.......}}.))))..},,)}............,},..,,,}.))))))))))).........((((.(.((((((((((((...)))))))))))),,)))).},...})))},}}))}}}}}.{||{|,{(({(({({..{{{{,,.{{{{||,..(((((((.,(((........{{{{{.,.}))))})),,))))))),||.,((((.{{.((((((....(((({(({(,,,,...(({{,..}|,|}},}}..,})))).........}}.)))).....)))))).}}.)))).,)),})}))).,,)}})}))))|||}}{.{{,.,},})||,|{,|}}..,,)).))))})))))))).))))).))).))))).))))))))..)))))..))))))).))..))))))))).......))).,,.....)))).))))))))...))))))))))))))).)))))..))))))))))))).))))))).)))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.