Basic Information

Symbol
hsa_ATXN10_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ATXN10_0112
Host gene
ATXN10
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:46085673-46136418 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:45689793-45740538 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-271.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -288.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 258.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((.....)))))...((((..(((((.((.((((((....((((((((((((((((((.......)))))))....)))))))))))(((.(((((...((((((((((...(((((.....)))))...)))..))))))).))))).)))...)))))))).)))))))))...(((((((.(((((.(((((((((((((..((((((((((((((((.........(((((....)))))((((......((((((..........))))))))))(((((((((..............)))))))))...))))))))..((((..((((((..(.........)..))))))..))))....))))))))((((....))))....(((((((((((.(((...(((((...(((((((((.((((((((((((....)))).)))))....)))..((((((((((..((...((((.((((....))))...))))....))......)).)))))))).....((((((.......))))))..........(((((......)))))....(((........)))))))))))).)))))..))))))))))))))...((((.(.((.((((((((......)))....))))))).).)))).(((((((.......)))))))...)))))))..(((((........).)))).)))))).).)))).))))..)))((((((..((.((((((((((......))))))).))).)).........((((((.(((.((.......)).))).))))))((((((((((.......))..))))))))......))))))..(((.((((.....)))).))).(((((.......)))))))(.((.((((...(((..((((.((((.....)))).))))..))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(({({,,({{(|((((((((((.,,((((.((.((((((....((((((((((((((((((.......)))))))....)))))))))))(((.(((((.,,((((((,(((...(((((.....)))))...))),,}))))}}.))))).))),..)))))))).))))|||||....}}|||{.(((((.(((((((((((((.,((((((((((((((((.........(((((....))))){{{{.....,((((((.,........))}}}}}},,{{(((((({.|.......,,.},))))))))}...))))))))}.((((..((((((..{.........}..))))))..))))....,)))))))((((....))))....(((((((((((.(({..,(((((...(((((((({.(({{{{{{(({(,,,,|||||||}||....|||..(((((((({,..,,...((({.((((....)))).,,))))....}}|.....)),)))))))).....((((((.......))))))..........(((((......)))))....,(({{...}}}).}))))))))).))))).,))}))))))))))}...((((.{.((.((((({{{......})),...))))))).).)))).(((((((.......)))))))...)))))))..{{(((........).)))}.)))))).).)))).}}}|{{|||,,,)}})),}.,..|)))))))))),,})}}}},|}}}..||||||..,,|||(((,({(,({,,,,.,,|}.|}}.}}}}}}{(((((((,{.......)}..)))))))}{{......))}...(((.((({...,,|))),))).(((((.......}}}}}})}}}},|||{..||{{..((((.{(((.....)))}.))))..))}})})}})
Forensic Context

No forensic context available.