Basic Information
Symbol
hsa_ATXN10_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ATXN10_0079
Host gene
ATXN10
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
22:46088876-46202984
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:45692996-45807104
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-279.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-298.15 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
345.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((.....(((((((((((.((((........((((((((((((......(((((((..(((.......((((.(((((.(((((((((((((..((((((((((((((((.........(((((....)))))((((......((((((..........))))))))))(((((((((..............)))))))))...))))))))..((((..((((((..(.........)..))))))..))))....))))))))((((....))))....(((((((((((.(((...(((((...(((((((((.((((((((((((....)))).)))))....)))..((((((((((..((...((((.((((....))))...))))....))......)).)))))))).....((((((.......))))))..........(((((......)))))....(((........)))))))))))).)))))..))))))))))))))...((((.(.((.((((((((......)))....))))))).).)))).(((((((.......)))))))...)))))))..(((((........).)))).)))))).).)))).)))))))..))))))).((.((((((((((......))))))).))).)).........((((((.(((.((.......)).))).))))))((((((((((.......))..)))))))))))...)))))))))((.((((.....)))).))(((((((.....(((.((.((((((..(((..((((..((((.((((.....)))).))))..))))....)))..)))))).))))).....)))))))........)))).)))))))))))........((((((((..((((((((........))))))..))..)))))..)))((.....))....((((...))))..))).)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.{((,{{{.{{{((((((((,((((.,..((,((((({((((((({,,,{{{{,{|||||||||,.,,.}||||.(((((.,,{{|||||{{|{,|||||{{,{((((({{,.}},,,,,,|||||,,,,)}))}{{{{....,{((((((,,....,...}}|||||},,,{{{{|{{{.|,......,},},))))))}},...}}}}}}}},.((((,.((((((..{.........}..))))))..)))).....})}})}}((((....))))....((({{{{,((({(((,..{((((,..{{,,{{{{{,({{,,{(((({(,,{,||||,|||||,.,.|||..(((((((({..,{{,,.(({{.((((....)))).|||}}}....,|},....}},,}}}}}}},....||{||{,,,,,..}|||||{{........(((((......)))))..{,,(({{...}}}).})}))}}}}}.||||,,{|||||}},|||||,...(({{.{.((.{((((|||,.....,)),,..))}}))).}.}))).(((((((.......))))))).,,)))))}}..,||||...,.,,,),},}}}))))},.}.}}}},}}}}|||||}}})}}))|}}||,|{|||||,,,},.)))))}}.))}}}}}},,...,.||{{{{,|||,|{,,,,.,,}}.)}),)}}}},{(((((((,{.......)}..)))))))),|,,,.}}))),..|||,||||,..,,}))),|}(((((((.....(((.((.((((((..(((..((((..((((.((((.....)))).))))..))))....)))..)))))).))))).....))))))).,}}}}},)))).)))))))))))..,,},..|||{{(({..{{((((((.,.....,))))))..))..))))}..|||{,.....|,.....,,},,,}},)}.,)}.)))).....
Forensic Context
No forensic context available.