Basic Information

Symbol
hsa_ATXN10_0005600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ATXN10_0024
Host gene
ATXN10
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:46096182-46136418 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:45700302-45740538 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-194.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -210.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 221.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.........(((((....)))))((((......((((((..........))))))))))(((((((((..............)))))))))...))))))))..((((..((((((..(.........)..))))))..))))....)))))((.((((....))))............((((((((...(((((............((((((((((((....)))).)))))....)))..(((((((((..(((((.((...((((....))))(((((........))))).......((.(((...))).))((((((...(((((((........(((((......)))))..(((((((.(((....)))))))))).((((.(((.(((...(((((..((((((.(.((.((((((((......)))....))))))).).)))).(((((((.......)))))))...((((.......))))..(((((.....)).)))..))..)))))..))).))))))).)))))))...))))))..)).)))))..))))))))).......((((((.(((.((.......)).))).))))))((((((((((.......))..))))))))......)))))....))))))))((((((..(((.((((((............)))))).)))..)))))).((((.((((.....)))).))))..........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{,(((((((({.,.......(((((....))))){{{{.....,((((((.,........))))))}}}},{(((((((.{.......,,.,,))))))}},.,.})))))))}.((((,.((((((..{.........}..))))))..)))}.....}}}}{{.((((....))))............((((((((...(((((,,,.......{{(,{,,,((((((.,{{||,,..||||{.,.{{,..(((((((({..(((((.(({,.((((....)))),{{{{.......,|}}},.,,....{{.{{{...})).}}{(((((...(((((((........(((((......))))).,((,((({...|}}).)),}},,,,|.((({.(((,(((...(((((.,{,((,{.{.||.{{{{||||,.....,))},..))}}))).,.}}}}.(((((((.......))))))).,}||||}.....}))}},,|{||||,,.,}),)}}..,}.,}}}}},,}}},||}}})),))))))).,.))))))}})}.)))))..,))))))))}},.}}}||,,,,}|||,|,}}}}.}},,.)})}),,,|,{((((((({{.......)}..)))))))).,,,,.)))))....))))))))((((((..(((.((((((............)))))).)))..)))))).((((.{(((.....)))}.))))..,,,,,,}.})
Forensic Context

No forensic context available.