Basic Information

Symbol
hsa_BBS2_0005400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0039457 hsa_circBBS2_003 hsa-BBS2_0001
Host gene
BBS2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:56539862-56548592 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:56505950-56514680 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-184.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -198.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 247.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......(((.((((((((......((.((((((.(((((....(((((((.(((...)))..)))))))..)))))(((((((((((((((.........((((((((....))))))))((((((..(((.((..(((.((((((.((.(.(((.......))).))).)).)))).)))..)).)))..))))))...((((((.(.(((((((((((.(........).).)))))))))).)))))))))))))))....))))))).((((((.((...((((.((((..(((.(((...(.((....(((((.......(((......((((((((((...))).))))))).......)))......))))))))...))).))).)))).)))).)).))))))........)))))).)))))))))).)))..(((..........))).(((.((((((((.((...((((((((...((((........)))).))))))..))...)).))..)))))).)))....)(((((((.(((..((((((.(((((((..((...(((((((....)))((((((((.((((((......((.((((....))))))))))))..))))))))))))...)).)))))))..))))))......))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,,,,,.,(((.,(((((({,....{({.(((((({{{{{|,,,.(((((((,((,...))}..)))))))..}}|||{{{{{{{(((((((({{.......((((((((....))))))))((((((..(((.((..(((.(((({{.((.(,((({......)))},)),)}.)))).)))..)).)))..))))))...,{{{{(.(.(((((((((({.,........,.,.)))))))))).)}}))))))))))))....||||||},,,}}}}}},.,{((((,{{,,..{|,.||}},.,}}}}}}))}})},{(({....}}}||{{((({{({((({,,,}|,,||||}}{,{,{{{{.{{{{,..,,})))).)))),)..}..)))}})).}},))}}})})}}}|||||||||||{||}}}||||,.,},.,|||..,.......}}}.{{{.{(({{(({{{{....,({((({...((((,.......}))),)))))).,,},|,|||}},|}|}}}},||}.,|,|{{{{{{{.{|||,((((((.(((((((..({...(((((({....}))((((((({.((((({....,,{|,{{{{,,,.}}}))}))))))..))))))))))))...)).)))))))..)))))),,,}},))),)))))))
Forensic Context

No forensic context available.