Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0005300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0158
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
16:16108348-16110774 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16014491-16016917 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-155.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -166.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..((((((((.......))))))))((((((.((((...((((....))))...)))).))))))((((((..((.(......).)).)))))).........(((((((((((.(..(((....((((((......((((((((.......(((....))).......))))))))...))))))..((.(((((((((((.((....((((((.(((.((........)).))).))))))....)).))).((((..........))))...(.(((((..((((((.(.(.....).).)))))).))))).).(((((((.(((((...((((((.....))))))......((((((.......(((((...))))).........(((.((.......)).))).......)))))).))))))))))))..)))))))).))((((((((((((((((...))))))((((......))))....))))).)))))....))).).)))))))))))....))))))))...............
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((..((((((((.......)))))))){(((((,((((...((((....))))...)))).)))))|((((((..((.(....,.).)).)))))),........(((((((((((.,..(((....((((((......((((((((.,,....(((....))).....,.))))))))...))))))..,{.{(((((((,({.((({.((({((((,.,{(((.(((.,{{{....,}}...,,,,.{((,,,..,,,..}}},,,,{|||.,,..,})}}})}},)}}.))),}))),}))}).))).)))}.,...((((((,,(((({...((((((.....))))))......((((((.......(((((...))))).......,.{{{.{{.......}).))).......)))))).}))))))))))),.)))))))},||((((((((((,{{(((...))))),((((......))))....)))))))))))....))).}.)))))))))))....))))))))...,,,....,,...
Forensic Context

No forensic context available.