Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0006400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0198
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16110353-16162159 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16016496-16068302 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-461.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -486.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 355.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((........(((....)))...........((((((...((.((((..((((((((.(((((.((((....((((......((((..((((((.(((..(((.............((((.((..(((((..(((((((...((((((.((((((((((....)))).(((((..(((((((((((.((((((......))))))(((.((((((.(((((.(((.((((....))))(((.((((.(.......).)))))))((((((((..(...((......))...)..)))))))).((((.((((((......))))))....)))))))))).))))))))..))).........((((...)))).((..((((((((((((.((((((((...))))......(((((..(((.((...))))))))))..(((((.((....)).)))))..))))))))))))))))..))((((((.....((((.......(((((((.(((((((..(((((((((.........))))........((((((.....)))))))))))(((((.(((((.((............)).))))))))))...((((......))))......((((((...))))))...........(((((((.(((.(((((((((((..((((((((((((((((((.(((...))).))))))))))))..((((((((((((((.((((((((......)))).)))).))........((((((((((........))))))))))(((((((.((.(((....))))).))))))).......(((((.....))))).............))))))))).)))((((..((.....))..)).))))))))..))))))))))).)))((((((......)))))).)))))))...)))))))))))))))))).....))))))....))))))).))))..).)))).......)))))).))))))...)))))))...)))))..))..))))..)))..))).)))))).))))))))....))))))))).))))))))))))..)))))))).(((((((.........)))))))..)))))))))))(((((((......(((((((((.((.(((....))).(((.....)))((..((((.(((.......((((....))))......))).))))..))....((((((..................)))))).......)).)))))))))......)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((((.(((..{({{..(((....)))......{(((((((((...,{({,.{({.(((.(((.({,..(((((((((((.(((.,(,.......,),))).))))))....(((((((...{{(,((((((..((((..((((((((((({{,(,.{{(((((((....))))}})),|||((((.(((((((((((((......))))))....)))))))})))||||(({(((...,{||}|||,((((.(.......).)))))}),||||),,.,}}.,)),)).))))))).))))...)))).))..))))..))}...)))))))..........)))))...)},.))).))).)))))....}))))))))|,..((((((((((((.((((({((...}},,,,....(((((,(({(.{{...,)))})))))..{((((.({....}).))))).})))))))))))))))){{|,........((((((((..((((({{((((((.({,,,..{({,.,,,,..,,...,,,,)))))))}.),}))))...(((((((((((..(((((.(((((.((............)).)))))))))){(((((.,.,...(((((.....((((((...)))))).......)))))..,},)))))}(((((((((((..((((({((((((((((((.(((...))).)))))))))))),.{{{.(((((((((,..,((,,(({{{{..||||{||,,...........((((((((((........)))))))))){((((((.((.(((....))))).))))))}.......(((((.....))))),}}},.}}..}}}))),,)),,.|||{{....||},.))))))))),)))))))..))))))))))){{.{,((((((((,{({(((((((({{.{{{{{.,|,,|,..|(((({{(((({.,,,{{({{..,{.{,,{,,({{{..,,|||,{{,.....)))))).},,))}}..,,}}}}...}||||.(((((((,.((((((({{,........)))))))))..))))))).,,,|,|||{{{{({{{.{{.,..,}},||,,}}}}.})))).))))))},}}.)))))}))))|(((((((((....)).)))...)))).}},}))))))).))}.,..)))))))).}.}}......((((....))))...)))))))))))..)))))))).........},}.||....,}}})}}))...|,,,},|)),)))).{,{....}})))}}
Forensic Context

No forensic context available.