Basic Information
Symbol
hsa_ABCC1_0006300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0090
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16110353-16184445
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16016496-16090588
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-807.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-841.92 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
675.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....((((((((.......(((....))).......)))))))).))((((((.((((((((((((((((.(((.(((((.(((((((((((((..((((.((((((((.(((((((((((...(((.((((((..((((..(((((((((((((((.((...(((((....))))).))))))((((.(((((((((((((......))))))....)))))))))))((((((.(((...((((((((.((((.(.......).))))))).)))))...))).)))))).))))))).))))...)))).))..))))..)))...)))))))..((((((...(.((((.(((.((((......).)))....))))))).)....))))))(((((((((((((.....((((...((..((.(((((((..(((..........(((((.((....)).))))).)))..))))))).)).)).)))).....)))))))).)))))........)))).))))))))..))))........((((((.......((((((.....))))))((((((.....((((((..(((((((.(((.(((.(((((((((((((((.......(((((.....((((((...)))))).......))))).....))))).(((((((((((..((((((((((((((((((.(((...))).))))))))))))..((((((((((((((.((((((((......)))).)))).))........((((((((((........))))))))))(((((((.((.(((....))))).))))))).......(((((.....))))).............))))))))).)))((((..((.....))..)).))))))))..)))))))))))((.(.((((((((((((((((((((((.(((((.........((((((((((((....(((((..((.((....((((..(.(((.(((.....)))))).)..))))....))))...))))).(((((((..(((((((((.........)))))))))..)))))))....(.(((((((((((.((.....)).))..)))).)))))))))))).....)))))))))))(((((((((....)).)))...)))).)).)))))))).))).)..)))))))).).))......((((....))))...((((((((((((((((((((((((...((((((.(((.......((((((((.((.(((((((.......).))))))..)).)))))).))........))).))))))..(((((......)))))((((........))))...)))))).))))....)))))).)))))))))))))))))).))).)))))))((((((..((((..((((..(((......)))))))...))))))))))(((((((.........))))))).....(((((....((((((((.(.(((((...((.((((((((((.(((((((((.....))))))))..........).))))))....)))).))...)))))).))))))))..))))).(((((((((........(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))(((((......))))).)))))))))(((((.(((((((.((((...(((((........)))))....))).).)))).))).))))))))..))))))..))))))...))))))..)))))).((((....)))).....((((..(((((........((......)).......)))))..))))..(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).)))))).)))).))))).)))((((((....))).)))..)).))))))).((((((((.....((((.......)))).......)))))))).((((.(((...(((((((...))))))).....)))))))(((((....))))).((((((((...................)))))))).))))).)))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{...((((((((.,{....(((....))).....,.)))))))}.,,{,{{{....||||(.{(((,(((((((((((((((.{{,..(({{....{{{,,||,|||,.,,,,,(((((((...{{(,((((((..((((..(((((((((((,{,(,.{{(((((((....)))}}})),|||((((.(((((((((((((......))))))....)))))))})))||||(({(((...,{{{}|||,((((.(.......).)))))}).}}}})...,}}.})),)).))))))).))))...)))).))..))))..))}...)))))))...,{{{{,,.(((((.((((..,,,,...,,|.,,}|,..||,|||.((..((((((((((((.((((({((...,}},|,....(((({,((((.((..,}))}})))}}..{((((.({....}).))))).}))))))))))))))))..)).))},}}}...,(((({.((.(({.{((((((((({,((,,((.({{,.......{((,(((({{....{(((((.....)))))}((((((((({.(((({((({(({{({.(({.(((.(((({{{{({{{(((,,.{,..(((((.....((((((...)))))).......}}))}..,|,|}}}},(((((((((((..((((({((((((((((((.(((...))).)))))))))))),.{{{.(((((((((,..,((,,(({{{{..||||{||,,...........((((((((((........)))))))))){((((((.((.(((....))))).))))))}.......(((((.....))))),}}},.}}..}}}))),,)),,.|||{{....||},.))))))))),)))))))..))))))))))),{,{,((((({({,{{{(((((({{{{.{{{{{.,|,.|...|{(((|{(((({.,,.{(((,...{.,,,{{,({{{..,,|||,{{,.....)))))).),,)}}}..,,|}}}...|||||.(((((((..(((((((({,........)))))))))..)))))))..,,|,{{(((((((({,,,.,..,,},||,,}}}}.})))).)))))))})},)}})}})))))(((((((({....)).)))...)))).))}}))))))).}}}.|..}))))))).|.,,......((((.,.,||||,,,({{((((((((((({{{(((((((,,.,(({((,(((,,,,.,,(,{(({{{.((,(((((((,,,,,.,|,|||}}},,||,}}}|}}.||..,,,...})),))))}}..{((((......)))))((((........))))...))))}).}))).,,,}}}))),,)})}}))})))}}}))}.}}}.))),)}}((((({..((((..((((..(((......)))))))...)))))))))){((((((.........))))))),,,,)))))))}))|{||{(((,((((((({,{({.,{{,(((({{.{((((((((.....)))))))).,,,,.....|,|||||||,,,{((|.,|..,||||}}}})))))}),}))))).{((((((((,,.,,,..,{{.{{{.((((.((...((((((.....))))))...)))))))}}.}}|{{{{{...,..})))),)))))))))|||||,|{||{{{.||||,...{{{|,,,|,,.}))))),}}}}}),}.)))),))),)))))}}},,})})))))))}))),}.,||}|}{,||||||,||||}}|||||{{{{.,,,..,}||||,........{{,|||..|{{{{{,{.|||||{,|||,|.|||.{{.(((..(((((((........))))).))..)))}},)))}))}}))}})}.|,|||.},}},))}})}))}})}.},)}}))))).}|||||,||.}}.}}}||}}}}}}.,))).)).})))))))),)}}})}))})},}|((((((...))))))|((((((..,||.{{(((,...}}}}}.||,...}}}}..,,..))))))}..)}))))))))}))))).)))})))...)
Forensic Context
No forensic context available.