Basic Information

Symbol
hsa_chr16_0039400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0094
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
16:16149743-16173920 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16055886-16080063 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-481.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -507.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 441.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.