Basic Information

Symbol
hsa_chr16_0039500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0140
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
16:16152622-16153551 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16058765-16059694 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-364.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -380.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 149.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((..(((((((.((((.((((....(((((((((((((((((((((((.((((..(((((((((((.((((((((((((((((((...((.((.((((((........((((((((.(((((((.(((((((((.(((((((((((((((((.(((.((...)))))........((((((((...))))))))...............((((...))))......((((((((((((..((((((.(((((((((......)))).......((((((...........................))))))...(((((.....(.(((((((((((((...((((.(((((((((((....(((....)))...))))..........)))))))))))..........))))))))))).)).)........)))))..........((((....)))).....((((((((((.((((.(((((.(((((..((.(((((((.....(((....((((((....(((((((.(((..(..(((((((((....))))))..((((((..(((.(((..(((....)))..))).))).....)))))).)))..)..))).))))).))....))))))....))).....))))))).)).))))).))))).)))).))..)))))))))))))))))))...))))))))))))..........((((......))))))))))))))))))))).))))))))).))))))).))))))))........)))))).)).))...)))))))))))))))))).))))))))).))...)))).)))))))))))...))))))))))))....)))).).))).)))))))..))..)))))(((((...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..((..(((((((.(((,{((((....(((((((((((((((((((((((.((((.{({(((((((((.((((((((((((((((((.,.((.((.((((((.{....,.((((((((.(((((((.(((((((((.(((((((((((((((((.(((.((...)))))........(((((((,...,)))))))...............((((...))))......((((((((((((..((((((.(((((,{{{......}}},.,|{{{.((((((...........................)))))).}}|(({{...,.,{({(((((((((((...(({(,(({{,||||{..,,.{((....))|,,,||{..||,|{,,...,})))),)},...,}},,,,))))))))))).)),........,|||,,..,})}....((((....)))).....{(((((((((.((((.(((((.(((((..((.(((((((...,.(((....((((((.,..(((((((.(((..,.{((,((((({,,.,|}}}}|,,..,{(((({(({({,..{,|,..}}))))),,,}.}))}..}})).},))).})).))).))))).))..,.))))))....))).,...))))))).)).))))).))))).)))).)),.}))))))))))))))))))...))))))))))))......||,.{{{{......))))))))))))))))))))).))))))))).))))))).)))))))).}....,.)))))).)).)).,.)))))))))))))))))).))))))))).))...)))).))))))))))}...)))))))))))).,..)))).).))).)))))))..))..)))))(((((...)))))
Forensic Context

No forensic context available.