Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0014700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0095
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
16:16169013-16171801 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16075156-16077944 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1003.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1049.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 577.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((((.((.(.(((((((((((((..((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((..((((((((((((((((((......)))))).))))))...............................((.((....))))...(((((((......)))))))))))))))).)).).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))..))))))))))))).).)).)))))))))))))).(((((((((.(((..((.......))..))).....................((.(((((((......))))))).)).......))))))).(((.((...((((((((.((((((((((((((((((.((((((((((.(((((((((((..(((....)))((((((((..(((((((((((((.....(((((((....).))))))...((((...........)))))))))((((...)))).(((((((.(((((((.(((((.(((((((((.((((.((((((..(((.......)))..)).)).))(((((.(((...))).)))))...((........))......))).).))))))).)).))).))...)))).)))...)))))))((((.(......).))))))))))))...((((((((.((((((........(((((...((((((.((((((((.((........)).)))).))))))))))....))))))))))).))))))))..))))))))(((((.(..(((........)))..).)))))......((((.(((.....)))))))(((....)))......(((((((....))))))).((((((((((.......)))))).....)))).((((((....)))))).((((((...(((((((((..(((((..(((((..(((((((((((((.......((((..(((((((((....)))))(((((......((...((((.....))))...)))))))))))))))........(((.((((........)))).))).((((......)))))))))))))(((((.......((((((((((....(((((((((((((.(((.((((((.((..((..((((.((((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..))...))(((....))))))))).)))...(((((((....))))))).......((((..........))))))))))))).....((((...........))))(((((.((((...(((..(((((((((((.......))))))((((......))))..))))))))..)))).))))).......)))))))))))))).......)))))((((...))))))))..))))))))))))))))))).....))))))..))))))))))))))))).......))))))))))))))))).)))))...((((((.((((((((.((.................(((...)))........((..(((...........))).)).......)).))))))))...)))))).....))))))))..)).))).....((((..((.(((((((((((.....((((((...))))))...(((((.....).))))((((((((((((((((.(((.....)))))))((((((((((((((.(..(((((((((((.((((........((((.....(((((((........(((((((((((((........)))))).((((((((((....(((((((((....(((((...(((((((.........))).......(.((((..((.((((((((..........)))).)))).))..)))).)))))...)))))..)))......))))))..............)))))).))))....((((((((..((((...((((.(((....)))...(((((((((((....((((((.((((((...))))))(((((((....((((.....(((.............(((((((((....(((.((..((((((((.............))))....)))))).)))......(((((((...(......)...)))))))..((......))..(((.(((........))).))).(((..............)))...))))))))))))..))))...)))))))............))))))((((((..(((...))).(((.(((((((((((((.....))))))).)))))))))....))))))...((..((((((((.....))))..((((((.......((((...............)))).......))))))..))))..)).)))))))))))((((....)))).........(((.((......)).))))))).....))))..))))))))..))))))).))))))).....))))..........((((((((....))))))))))))))))))....)))))...).))))))).....)))))))..((((((.......)))))).....................))))))))))))....(((.....((((((....))))))))).))))))))))).)).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((((((((.((.{.(((((((((((((..((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((,(((..((((((((((((((((((......}))))}.))))))...,........,..........,,......,,.{,....)})}...(((((((......)))))))))))))))).)).).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))..))))))))))))).,.)).)))))))))))))).(((((((((.(({..((,......,),,}}}.....................{(.(((((((......))))))).)),,,....)))))))}|((,((,,.((((((((.((((((((((((((((((.((((((((((.(((((((((((..(({....}))((((((((.{((((((((({(((.....(((((({....},})))))...((((...........)))))}})}|(((...))),.(((((((.(((((((.(((((.(((((((((.{({,.{{((((..(((.......)))..}},}}.}}{((((.(({...})).))))|,{.((........)).}.,.,})),).))))))).)).))).))...)))).)))...))))))){(((.{......).)))))))))))....((((((((.((((({.......,(((((...((((((.((((((((.((........)).)))).))))))))))....))))))))))).)))))))),,))))))))(((((.(..(((........)))..).)))))......(((,{(((.....)))))))(((....)))...,,.(((((((....))))))).((((((((((.{....,)))))).....)))).{(((((....)))))}.((((((..,(((((((((,.{((((..(((((..((((((((((((({,,,......}}}|((((((((....)))))((((,.....,((.,.((((.....))))...))))))))))}|{{,...,}},.(((.((((........)))).))).{(((......)))))))))))))(((((.,.....((((((((({...,(((((((((((((.(((.((((((,{{..((..((((.((((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..))...||(((....))))))))).)))...(((((((....))))))).,.....((((,.......,.))))))))))))).....((({...........})}}(((((.((((...(((..(((((((((((.......)))))}((((......))))..))))))))..)))).))))).......)))))))))))))).......)))))((({...})))))))..)))))))))))))))))))..,..))))))..))))))))))))))))).......))))))))))))))))).)))))...((((((.((((((((,({.......,,,,.....,|||...,,,........((..(((...........))).)).......,}.))))))))...)))))).....)))))))),,},.})),.,..,{((,.({.(((((((((((.....((((({...})))))...{((({,,...}})))}{{{{{{{{((({((((.(((.....))))))),{({{{{{{{{|{{.{,,(((({{{{{{(,{(({,,.,,,,.((((...,.(((((((,,....,.(((((((((((((........)))))).((((((((((....((((({,,{,,{{{{(((,...,.{{{{{.{{|,,..,.,.,..,.,,.}))}}.,{,((((((..{{{{{......,,..}))..))}}),))))),,,...)})}}..}))......))))))..............)))))).))))....{(((((((..((((...((((.{{({(((,,....{((((((((((....(((((,.((((((...)))))){((((((,.....,(.{(,,((.|||,...{....{(((((((((....(((.((..(((((({{...,,....}...}}}}....}))})).)))......{((((((...(......}...))))))},,{{......}}..(((.(((........))).))).({,...,}.,..,}}..}},...))))))))))....)))...})))))),.....}))))))))}))},,{{{,..{,....,,}.(((.(((((((((((((.....))))))).))))))))),{{((((((....((({....||||..}}}))))}}{(((((.......((((...........,...)))).......)))))),}}},},,}..))))))))))|((((....,|||.....}}.||}}}......,.))))),)))).....))))..)))))))}..)))))))}))))))}.....)))).,..{{{{{.,,,,||||},,,|||||}|||}}}}}}}}}....}))))...}.))))))),,.,,)))))},..{(((((.......)))))}..................,..})))))))}))}....|||,....{((((|....,)))))))).))))))))))).)).))))))
Forensic Context

No forensic context available.