Basic Information
Symbol
hsa_ABCA1_0001500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087803
hsa_circABCA1_022
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107550707-107565597
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104788426-104803316
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-463.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-494.37 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
451.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...((...((.....)).))..))))))(.((.(((((((((.(((((.....((((.((((...((((((((((.((((((..((((..(((((.((((((((...............((((((((((...(((((((((((((((((...(((((((....)))))))))))..)).)))))))(((((.((((.....(((..((((.((((((......(((((((((.......)))))))))....(((((.(((.....))).)))))...)))))))))))))..((((......))))(((((((.((((.((.(((((((((.........)))........)))))).)).)).))..)))))))..((((((.(((...((((((........)))))).)))))))))))))...)))))...))))..))))))))))..((.((.(((((((......))))))).)).)).........(((.((((((((.((((((...(((((((.(..(.((((.(((..((((.(((((((((((((....)))).)))))).((((...)))).......((((((.((((((...)))))).(((...(.((.((((((((...((((((((((.(((............)))))))))))))...((((....((((.(((.(((.(((((((((((.(((((((((.(((((((((((..((((((..((((((((((((.((((.((...((((..(((((((((.((((((....)).))))..)))))(((..((((....(((..(..(((((...)))))..)..)))...))))..)))........))))..))))...)).))))..))).)).).))))))...)))..)))..))))).)))..)))...)))))(((((((...((((((((((.(((......))))))..((.((((((..((((((((..(......)..))))))))..)))))).))......((((.(((...))).)))).........((((......)))).....)))))))..))))))).......)))).))))))....))))))))....))))))).....)))))))))))).)).)..)))..........((((....)))).))))))....))).))))..))))))).)..).)))))))...........))))))..)))))))))))(((.((((((...........)))))).)))........(((((...((((((.....(((((((...(((((....((((((...)))))))))))......)))))))....))))))...)))))............((((....))))...)))))))).)))))...)))).)))))).)))).)))...)))))))...))))((((....))))...))))).))..))))))).)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,{,,.,....{|,,{{,|,.|{,{|||}}|(.((,(((((({{,.,{{(({{{{{.,,,,||||,.,,{{{{{,,,,,||||.,,}}}||..|||||,||{{{.,,...|||,....|||||,|||{({(({,.(,,((((((((((,{{,..,(((((({....})))))))})}..)).)))))))),{({,,........,}},.,||||}.{{{{,.....{((((((({.......}))))))))...}||||{.|||,....,||,|||||{{.(((|,..(((.((((((((((((((({{..{({{...|||,......,.,|||,.........}}}.((((.(({.,((((((((((..,.((((({,{{((((,..{||||,|{(((({{,,..,,,|||,|{|||||,|||{{{{{{{{,{((({.|{{{,,|||,(((((({,,,..{{((({{{|}}},,,)}}}}})}))})).....,,,,||,.,,,,{((({(({{{({,.{{,{|||,|,}},||||.{{{..,,,{,{{,((((((((((....})))}}))))).((({...}))}.......,,,,,,.((((((...)))))).(((...{.((.(((((((({.,({((((((((.(((............)))))))))))||,.......,,,((((.(((.(((.(((((((((((.((((.,{((.{{{((((((((..({((((..((((((((((((.((((.((...((((..(((((((((.{(({((,...,)}))),..)))))(((..{{{{....{{(..,..(((((...)))))..,..})}...))))..))}........))))..))))...)).))))..))).)).).))))))...)))}.}},..))))).)))..}))...}}|||(((((((.,.(((((((((,.,((...{{,||||,|{{(({((((((..((((((((.{{,,....)}}))))))))..))))),.,,......((({.(((...))).))))......}}}||||}}}}}},,))...}}))))))).,))))))).,,,,..)))).))))))....))))))))....))))))).....,))))))))))).)).,..)))...,,.,.....}))))}))).})))))))))}))).))),|||}|||||{|{.,.|}})))).,}|{|,.,,)))}))},,|||||||||,|,,{,{|||||}}}},,...,,)))))).}},..}}}},,{{{{{{,.((((((...,,((((({{..,{|||,...{((((((...})))))),,,,.....,)))))))....})))))..}))))).,{{{{{{....((((....))))...,))))))))))))..}))))))))).,)))))))},....,.)),))))))).))))))))..))).,.))),)}))).,.,,}))})}.)
Forensic Context
No forensic context available.