Basic Information

Symbol
hsa_chr16_0039800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0106
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
16:16198480-16198874 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16104623-16105017 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-192.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -198.05 kcal/mol
Frequency: 0.0001
Diversity: 82.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((......(..(((((((....(((.(((((.((((((.(..(((((((.(.((.(((((((((((((.(((.((...)).))).)).)))))))))))))).))).(((((((..((((((((..((((...))))..))))))))..(((((((..((.(((((....)))..))))..)))))))......))))))).(((((((((....(((...)))....)))))))))..........))))...).)).)))).))))))))..)))))))..)...(((((((((((..((...((((((..((.((((((..(((....))))).)))).))))))))..))..))))...))).)))).)))))))((......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,(((({({{{,.{(..(((((((....(((.(((((.((((((.(..(((((((.(.((.(((((((((((((.(((.((...)).))).)).)))))))))))))).))).(((((((..((((((((..((((...))))..))))))))..(((((((..((.({(((....)))..))))..)))))))......))))))).(((((((((....(({...}))....))))))))).........,)))).,.).)).)))).))))))))..)))))))..|,.,((((({{{,{{,.,,..}||||{{..||,|||||,|,||{...,|||{|.||}|,|,||||||..}}|,,}}}..,))).}}).,)))))))||}},,}},,
Forensic Context

No forensic context available.