Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0039100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0074
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:107550247-107555531 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104787966-104793250 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-147.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -159.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 88.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(...((((.(......).))))...).)))...((((((.((((.(((((..((((((((...((....................(((((.....((((...(((((....))))))))))))))(((((.......))))).............(((((((((.((((((((((...((((....))))..))).)))))).).))))))).))(((((((((......)))))))))(.((((((((((((((((((((((.((....))))))))...(((((..((((((((............))))))))..)))))((.....)).......((((((((.((..........(((((.....))))).....))))))))))..........(((((....)))))....(((((((......(((...........(((....))).........)))..)))))))............))))))))))).))))).).......)).))))))))..)))))..((..(((((........)))))..))(((((..........)))))......)))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(({,(.,,{{((.{......,.}}}}..,}.)))...((((((.((((.(((((..((((((((...{{,,...,,.............,,{,,...........,(((((..,,|}},,..}))|.,.(((((.......))))).}))),|..,{,{,,(((((((.{(((((((((...((((....))))..))).)))))).}.))))))),))|{(((((((......))))))))}(.((((((((((((((({((((((.({...,}}))))))...(((((..((((((((............))))))))..)))))((.....)).......((((((((.((....{|....(((((.....)))))..,..))))))))))..........(((({....}))))....{((((({......(((.........,.(((....))),........)))..}}}}}},............,)))))))))).))))).).......)).))))))))..)))))..((..(((((........)))))..))(((((..........)))))......)))).))))))
Forensic Context

No forensic context available.