Basic Information
Symbol
hsa_ABCC1_0021400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCC1_0105
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
16:16222782-16223450
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16128925-16129593
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-249.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-262.19 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
165.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(....(((....)))......).))))((((((((((.((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((.(((.(((((...((((.......))))((((((.(((((((((((....)).)))))).......)))....)))))).))))).))))))))))...((((((....))))))((((((.((((.(((((.((..(((((.........(((((...((((...)))).)))))......)))))...............((((((....((...((((........)))).)).))))))...(((((((((((.(((.(((((((((((...)))))))((((((..((((.((((((......)))))).)))).)))))).(((((......))))).)))))))...)))))))))))..((((....((((((....)))))).....)))).((((..(((((((.((((((((...........))))))))..)).)))))..))))..........((((((((.......)))))))))).))))).)))).)))))).....))))))))))))))))))))))...))))))))))).)))))))))).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.{.{{.(((....)))......).))))((((((((((.((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((((((((((((({{,.(((.(({((..{((({...,,..})})||{|||,|,.(((((((({....)})))))),,{,,,,{.{....|||}||.}}}))})},}}}}},....((((((....))))))((((((,((({.,{{{{.,,..({{{{.........{{{{{...{{((...}))).}}}}}......|}}}}...............((((({.,..{{|,,((({,,......||||.||.,||||,...||||||||||(,(((,{({{{|,,|||.,})))))))((((((..((((.((((((......)))))).)))).)))))).{((((......))))}.,||||||{{{{|,||,,.,}).}||||....((((({....})))))})))}||||.((((..((((({{.((((((((,,,....,,..))))))))..},.)))))..))))}}},..,,,,{({{{{{{.......,)))))))))}))}))})})),)))))}..,}))))))))))))))))))))))))},,,})))))))).)))))))))).))))))))))
Forensic Context
No forensic context available.