Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0079
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:107552300-107553817 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104790019-104791536 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-358.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -389.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 381.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)((.(((((.(((((((((((((.((((((((.(((.(((((((((((..(.((((((((((((.((((.....((((((.(((((((((...(((((((............(((((((((((.(((((.((((((.((((((((((((.....((((((.((((((.....((((((......(((((((.(((((.(((((((..(((((..(((.(((......))).))).)))))......((((((.(((((.((((((((((((((((((((.((((..(((((((....(((((((.....((((.........))))....))))))).......((((((((((.....))))).)))))............((((((((((...........)))))))))).)))))))...))))...))).)))))...................(((((.(......)))))).........((((((((.((...(((((....)))))...)).))))))))..((((.........)))).......(((((((((((((.....(((((((...))))))).....((((((((.(((((.(((((...(((((......)))))..))))).))))).))))))))..((((((((....))))))))....))))))))))))))))))))......)))))))))).))))))))))))).))))).))))))).....))(((((((((((.....((((((....((((((((........(((........(((((.....((((((.((((....((((.......))))...))))...)).))))....)))))..........)))......))))))))(((((((((.(((...............))).)))))))))................)))))).....(((((....))))).......))))))))))).........))))...)))))).))))))))))))..)))))))))))).).....))))))))))))))).......)))))))......(((((.(.((((((.........)))))))))))).....(((((((...)))))))............((((.((....)).))))......(((.((((....(((.((((......................)))).))).....)))).)))....(((..((((..((((..............((.(((.......)))))))))..))))..))).((((((..........))))))..(((((.....((((((((((.((....((((((.........))))))..)).)))).))))))...)))))...))))))))))))))).))))))))))))))))...)..))))))))))).))).)))))))).).)))......))))))))).))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.........,...)((.(((((.(((((((((((((.((((((({.(((.(((((((((((.{..((((((((((((.((((.....((((((.(((((((((.{.,,...........{({{{{((((((({{,{{((((({(({{,,,||||||,||,{,.....,,||||.((((.({{{...,,(((......(((((((.(((((.(((((({..(((((..(((.(((......))).))).)))))......((((((.(((((.((((((((({({((((((((,((((..{(({{{{...,(((((((.....((((.........))))....))})))}..,,,,.{(((,(((((.....})))),}}}},....,.......|||||,,{{|,,|,},}}}}}}})),}}}}}}))))))),}.)))}.,,}}|,|||||,,........,,}},,,,,{(({{{{......})))}}.........((((((((.((...(((((....)))))...)).))))))))..((((.........))))......{(((((((((((((...,.(((((((...})))))).....((((((((.{((({.(((((...(((((......)))))..))))).})))).))))))))..{(((((((....))))))))}...))))))))))))))})))))......)))))))))).))))))))))))).))))).))))))).....))},||{,,,...,,,..}})}.}}}}.,,,,,,,,........,(({{{{{{..,,,{,.....{{{{{{.,,{{....((({.......}}}}...,|||,,,|}.||||,,,,|||||..{,,,,,{{|||....,{|}||||||(((((((((.(((...............))).))))))))},.....,,.{((((({{...,{,,{,.((({(,,..}}}}}.,{{{{{,,||,},,}},,,}}}}})}}|||,,,|,||,}.}}}}}}},}}}}.,}}}))))))})},},....,}|},,||||,,,,,...}},,)))))))).....(((({,(.((((((.........)))))))))))).....,({{(((...,}}}}},....,}},,,,.{(((.{{....)).))))....,.|||,((((.{,,(((.{(((.....,................}}||,}}}.}},,)}}}.}}}}}}}||,.||||.,,}))))}}..}}}}}}|.,{{.(((.......)))},...,,)))))}})....)))))))}}))}...,,..,,..{{{{{..,..(((((({(((.((....((((((,......,.))))))..)).)))).)))))),,.))})).}}))))))))))))))).))))))))))))))))...,.,))))))))))).))).}))))))).}}}))......))))))))).))))).))
Forensic Context

No forensic context available.