Basic Information
Symbol
hsa_SLC8A1_0001000
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0120047
hsa_circSLC8A1_018
hsa-SLC8A1_0007
Host gene
SLC8A1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:40342512-40405633
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:40115372-40178493
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-313.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-330.35 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
224.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.......((((.((((.....))))))))((((.((.((.......))..))))))..((((.(.((((((((((......(((((((((.((((((.((((((((((((((((((...(((((....)))))..))))))))))........((((((((...((((....))))..(((....)))(((((((....).))))))..((((......(((.(((.((((((((((((.....((((.(((...(((((..........(((((.(((((....((....))..))))).).))))((.........))..))))).((((.((.(((((............))))))).))))((((......))))..((((.........((((...(((((..((.((((.((.(((.(((..(((((((.(((((......((((((((....(((..(((.((((.((.........((((((.((((((((((((..((((((((.....(((...))).........((((((..((((((.......))))))............))))))))))))))..))))).))))).)).)))))))).)))).)))..))))))))))).))))).))))...)))..))))))))))))))..))))).)))).......))))))).)))).)))))))))))))))..))).....))))))))))))....(((.......((((((((......(((((((...((..((((((((.((((..(((((((..((......)).))).))))...)))))))...))))).)))))))))...)))))))).......)))((((..(((((.((........)))))))))))......))))))).).))))))))))))))).....))))))..)))).).))))))((.(.((.(((((....))).)).)).).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.......((({,((((.....))))))))((((,(,.{{.......},..,,))))},((((.(.((((((((((......(((((((((.((((((.((((((((((((((((((..,(((((....))))),,))))))))))........((((((((,..((((....))))..||{....}}}((((({,....,.})))))..{(((.,....(((.(((.((((((((((((..,..((((.(((,,.(({{{.....||...(((({.(((((..,.((....)).,))))).}.))))((,....,.,.}}..|||||.((({.((.(((((...,,....,..))))}||,|}}},,.,.,..,}}}.....,,,.......{,((((...{((({,,|{.({{{.((.(((.({{..(((((((.((((({,....,(((((((....{((..(((.((((.(,........,((((((.(,((((((((((..((((((({.....{,{{.{|||.........}}}|||..((((((.......))))))............,,,,,}})))))))..))))).))))).)}.)))))))).)))).)))..)))))))))))))}))).))))...))).,))))))))})))))..}}))}.)))).,.....,})}))).)))}.)))))))))))))))..))).....)))}))))))))....(((.......((((((((......(((((((...((..((((((((.((((..(((((((..((......)).)))},)))...)))))))...))))).)))))))))...)))))))).......)))((((..(((({{((......,.)))))))))))......))))))).).))))))))))))))).....))))))..)))).).))))))((.(,({.(((((....))).)).}},),))
Forensic Context
No forensic context available.