Basic Information
Symbol
hsa_XPO1_0002800
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0054853
hsa_circXPO1_095
hsa-XPO1_0044
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61709515-61717911
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61482380-61490776
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-250 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-274.5 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
229.3
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.....)))))).(((((((((((.((.(((((..........))))).))))))....(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............))))))))))))).....((((((((((((...(((((((....((((((.......))))))..))).))))...))))))...((((........(((.((((((((..............(((((.....))))).....((..(((.((.....)).)))..))..))))))))))))))).(((((((.......)))))))((((((.((((((.(((.(((.....((((((((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))..(((.((((((..(((...(((....)))...))).)))))).)))...........)))))))((((.....))))..((((...(((.(((....))))))..)))).((((.....))))...............((.(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))).))...........((((....))))))).))).)))))).)))))).((((.((.(((((........))))).))))))..(((((((((..((.(............).))........((((....))))....)))))))))......))))))......((((.((........)).)))).))))...))))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.....)))))).{((((((((((.((.(((((.......,.,))))}.}}))))....(((((((((((...((((.....))))..)),}))))))))(((({((((({{((((,((............))))))))))))}.....{((((({...(((.,(((((((.(((((,((((,....,,,,,}}},)}}.)))).,))))))).))).......,,,.,,,.((((((((........,,,.{.(((((.....))))),,,,,((..(((.{{.....}},)))..))..))))))))||||||,.{{(({{{.},....})))))){{{{((.{(((((.(((,(((.....((((((((((((((((..{{({{{((((({{...,,,)})))}}{{.{{,..,,)))}}((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))){({......))}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........))))))))){,{((.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).})),..........)))))))((((.....))))..,,,,...,,|,|||....}}}|||,,||||.{(((.....))))..}}}}}}}}.....{{.(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,....,)}.,...)))))).,.))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))),|||||}}.....,{{{{,|,,}}}}},,.})).)))))),))))}}.{({,,({.(((((........))))).}}))}}..{{{{(((((..,{{({{....,.,......,.|,...,,((((....)))}....}}}}}})}).....)))))))......((((.{,.,......)).)))).))))...)))))}.}.
Forensic Context
No forensic context available.