Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0002100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0085
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:107554222-107555451 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104791941-104793170 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-115.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -125.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 108.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((((..((.(((.(.((.(....).)).))))))..))))))))).))).((((.............(((((((((..........(((((((((..((......))..))))...))).))(((...))))))))))))....(((((((.(.(((..((((((((.(((((((((.........((((.....(((.(((((((((..........((((..(((((((((...(((.((((((.((..((((((((((...(((...((.(((((.(((.........))).).))))))...)))......)))).)...)))))..)).)))))).))))))).)))))..)))).........)))))))))...))).....))))))))))))))))).))))..)))).)))))))....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((((..(,{(((.{.((.(....).)).})))))..))))))))).))).((((.............(((((((((...,.......,||(((((..((......))..)))),..,}}.,,{{{...)}})))))))))....(((((((.{.(((..((((,((,{(((((((((......{{.((((,....{(({(((((({{{,,,.....,,|.,,.}||||}}}|,{{(((((((((((((((((......{({....}}}..,|{(((((.(((.........))).).,)))}},.)).))))))))))))))}{{({{{{({{{.,,,|}}|,,.,},.,)))}....))))))}}.,}))))}))}).,.)}}.....,}},))))))))))))).))))..))}).)))))))....)))).
Forensic Context

No forensic context available.