Basic Information

Symbol
hsa_TLK1_0002200
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0118068 hsa_circTLK1_023 hsa-TLK1_0044
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:171862657-171902872 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:171006147-171046362 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-195.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -215.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 244.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((....((((((((((((((((((((...........(((.(((....)))...)))....((............)).....((((((..((.((....((..........((........))............))....)).)).))))))..)))))))))).)).....)))))).))..))))).(((((((((.(((((........((((....))))...((......))....((((.........)))).......(((((((((...(((((((.((..((((........))))..)).))))((((((..............((((.....))))))))))..................((((((.....))))))...))))))))))))((((((((((((((..........)))))))....)))))))........))))).)))))..))))...(.(((((((.....))))))).).....................)((......(((((((.....((((...))))........((((......))))((((((((.......)))))))).(((((.(((...(((..((((((((..(((((((.(((.((((....(((((((((.((.(((((.(((((...(((....)))....)))))...))))))).)))).)))))...))))))).))...))))).....(((((...)))))...(((..(((((((.((((((((((((..(((((...........))))).((((((.(((.((..(((((........))))).)).))).)))))).)))))))).)))))))))))....)))....))))))))..)))....))).)))))))))))).....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({.,..{{((((((((((((((((((......,....(((.{((,,..})),,.)))....,|.....,......}},....,{((((.,({.,{,{,,.{,..,{{({..((........}}..........,,}|...,)),}},))}}}}..)))))))))).}}.....)))))).,,.}))))).{{{{(((((.{((((.,,....,({{{...,})))..,(({..{{{{{{.{{((((.........,,,........(((((((((...{{{((((.((..((((........))))..)).)))|((((((....,.........{{{{.....)))})))))),.................{{(({{.....}}}},}..,))}))))))))),,||||||,|||||}}.,}}}.,,||||||}...,,))))))},......))))}.)))))..}}}}...{.{((((((.....))))))}.}...,..............,,.)({......(((((((...,.((((...}}}}........((((......)))){(((((({.......)))))))).(((((,(({..,(((..(({({||{{((((((,,.,||}||||,...(((((((((.((.(((((.(((((...(((....)))....)))))...))))))).)))).)))))..{|||}},}.}}..,)))}}..,..{((((...))))),..{({..(((((((.((((((((((({..(((((...........))))).{{((({.(({,{,.{((({{...,...,}}}}}}}},))),})))))}))))))))}}))))))))))....)))}}|,}|}})))).})))....))).)))))))))))).....))
Forensic Context

No forensic context available.