Basic Information
Symbol
hsa_ABCA1_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0098
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107555111-107558478
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104792830-104796197
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-145.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-153.57 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
76.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((........)))(((((.(((.(((.(((((((((((.(((((((((.(((((((((((..((((((..((((((((((((.((((.((...((((..(((((((((.((((((....)).))))..)))))(((..((((....(((..(..(((((...)))))..)..)))...))))..)))........))))..))))...)).))))..))).)).).))))))...)))..)))..))))).)))..)))...)))))(((((((...((((((((((.(((......))))))..((.((((((..((((((((..(......)..))))))))..)))))).))......((((.(((...))).)))).........((((......)))).....)))))))..))))))).......)))).))))))....))))))))....))))))).........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((........)))(((((.(((.(((.(((((((((((.((((.,{((.{{{((((((((..(,((((..((((((((((((.((((.((...((((..(((((((((.{(({((,...,),))),..)))))(((..{(({....{((..,..(((((...)))))..,..))}...))))..))}........))))..))))...)).))))..))).)).).))))))...)))}.},,..))))).)))..}))...}}|||(((((((.,.(((((((((,.,((...{{,||||,|{{(({((((((..((((((((.{{,,....)}}))))))))..))))),.,,......((({.(((...))).))))......}}}||||}}}}}},,))...}}))))))).,))))))).,,,,..)))).))))))....))))))))....))))))).........)
Forensic Context
No forensic context available.