Basic Information

Symbol
hsa_TLK1_0008300
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0057032 hsa_circTLK1_018 hsa-TLK1_0095
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:171884849-171914707 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:171028339-171058197 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-166.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -181.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....(.((((.((((.((((((((....(((((.(((((((((.....))))))))...).))).)).....))....))).))).)))).)))).)....))((.........((((.((..(((.(((((((.....((((((....))))))....(((((...(((....)))...))))).......(((((.........)))))....................(((..(((...(((((((.......)))))))))).))).......(((((...)))))...)))))))))).))...))))...(((((.((((......((((((..((((((.......................(((..........))).............((((...((((((((.(((...))))))))))).....)))).........))))))..(((............))).)))))).....)))).)))))..........((((....))))((((((((.((((...............((((((...(((((((((((((......)))))...(((((....(((...((((.(...(((...(((.(((....)))...))).....))).).))))...))).............))))).......)))))))).))))))...............)))).)))))))).((((.((.(((((..(((.((..((((((.......(((((((..((.....))..)))...))))....)))))))).)))..))....)))))))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,..{.,(((,(((({((((((,{,,,,{..,...{{||||||.....}}}}}}}}...||}}},,.}}}}.{|,.|{||}.},)}))}),)}}}.},}},)){{...........,,.,,..(((.(((((((.....((((((....))))))....(((((...(((....)))...|||}}...,,,.{{(({.........}}}}}.............,,,,...(((..(((...(((((((.......)))))))))).))).,,,...(((((...)))))...)))))))))).}}...},}}|..{(({(,{{{((({,{{((((((..((((((....................,,.,{(,.........},,.............((((.{.((((((((.(((...)))))))))))...,.)))).........))))))..(({.,........,.})).}}}}}}..,,.)}}).})))}..,,...,}}||||,...))))((((((((.((((...............((((((...(((((((((((((......)))))}..(((((..,.(((...((((.(...,{(...(((.{((,,..})),,.))).....}},.,.))))...))).............))))).......,))))))).))))))...............)))).)))))))).((({{((.((({(..(((.({..((({((.......{{|{{||..|||,...,...,,.,.}}})),..,}}}))))).}}}..})....)))))))))....})
Forensic Context

No forensic context available.