Basic Information

Symbol
hsa_TLK1_0014300
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0118074 hsa_circTLK1_011 hsa-TLK1_0033
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
2:171938150-171939362 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:171081640-171082852 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-271.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -297.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 278.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((............(((((((((........)))).)))))((((((..((((((..(((((((..((((.((((((.......(((((.((((((..(((..(((....)))..))))))))))))))........))))))))))....))))))).........((((((((.....(((((...((..(((((((.(((((........).)))).)))))))..))...)))))......))))))))(((((((......)))))))(((((.(((((((..((.((((..(((((.........))))))))).))...))))))))))))............((((((((..(((((...(((((......(((.(((.(((((((.((..((...............((...((((.((((((...(((((((..(((((((((...))).)))))).........(((....)))..))))))))).)))).))))..))..............))..)).)))).)))..)))..)))......)))))..))))).)))))))).))))))..))))))....(((.....)))((((...((((.(((.((((.......((.((((.....)))).)).((((.((((((..(.(((((..................((((((.(((....(((((.((((((.((.....)))))))).))))))))))))))((((...))))........((((........))))..))))))..))))))..))))..)))).))).))))....))))((((((.............((((((((((((((((((((((.((.((.((((.((((......))))...((((......))))(((((...))))).....(((.(((....))))))..(((((.............))))))))).))))))))))))))....))))))))).)))........((((((.....(((((((((((((....)))))))..........(((.((((((((((....(((((..........))).))...))))))))))..))).......)))))).....))))))....))))))..((((...((((..((((.......))))..))))..)))).).))))(.......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,............{((((((((........)))),,)))|((((((..((((((..,(((((,.,((((.{{,,{{.......{((((.((((((..(((..(((....)))..))))))))))))))..,.,,,,}}},}}))}}....,}}||||{|{{{|,|{{(((((((.....(((((,..((..(((((((.(((((........)})))).)))))))..)}.},)))))......)))))))}{((((((......))))))|(((((.(((((((..((,((({..(((({,(,....}})))))}))).,),,.)))))))))))),...........{(((((((..(((((...{{(((...,,{(((...}}|||.....,...,,...........,,..||,..{{{{.{{{{|{..,|||||||..(((((((((...))).)))))).........{{(....|}|,,,}}}}||||||||}.}}}}.,)).....||{{{{{{.||||,,.,)))}.))))))),.,}}..,...)))),..))))}.})))))}}.))))))..)))))),...(({.....}))((((...((((.(((.((((.......((.((((.....)))).)).((((,((((((.,(.((((({((.........{{{.{{(((((,,(((,...(((((.(((((,{((.....)))))))).))))))))))))))|{|{...}))}..,,},,}||,|,,,,..,.}))),.)))))}..))))))}}))}},.)))).))).))))....))))((((((.......,,,...((((((((((((((((((((((.{{{((.((((.,(((,.....,|||{,.((({......}}}}(((({...}))))..,,}}}}}|.......|{.{{.{((,,,,}}.}}}}.....)))),)))).))))))))))))))....))))))))).)))....,,}.((((((..,..(((((((((((((....)))))))..........(((.((((((((((....{((((..........))).))...))))))))))..))).......))))))..,..))))))....))))))..((((.{,((((..((((.......))))..)))),.)))).},)))){{....},)
Forensic Context

No forensic context available.