Basic Information

Symbol
hsa_TLK1_0014400
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0118075 hsa_circTLK1_008 hsa-TLK1_0007
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
2:171938150-171974367 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:171081640-171117857 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-312.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -340.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 346.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((.....)).))(((....(((((((.(((((.(.((((((((.((((..((((((.(((((((.(((((((((.(((.((.((((((((.((((.((((...((((((.((....)).))))))..))))..(((((((((........)))).)))))((((((..((((((..(((((((..((((.((((((.......(((((.((((((..(((..(((....)))..))))))))))))))........))))))))))....))))))).........((((((((.....(((((...((..(((((((.(((((........).)))).)))))))..))...)))))......))))))))(((((((......)))))))(((((.(((((((..((.((((..(((((.........))))))))).))...))))))))))))............((((((((..(((((...(((((......(((.(((.(((((((.((..((...............((...((((.((((((...(((((((..(((((((((...))).)))))).........(((....)))..))))))))).)))).))))..))..............))..)).)))).)))..)))..)))......)))))..))))).)))))))).))))))..))))))....(((.....)))((((...((((.(((.((((.......((.((((.....)))).)).((((.((((((..(.(((((..................((((((.(((....(((((.((((((.((.....)))))))).))))))))))))))((((...))))........((((........))))..))))))..))))))..))))..)))).))).))))....))))....))))))))))))..)).)))......((((.....(((......)))...))))............((((......)))).....))))).)))).))))))).))..))))..)))).))))))).).).))))).......)))))))...((((((((((.((((((...)))))).....((((((.....(((((((((((((....)))))))..........(((.((((((((((....(((((..........))).))...))))))))))..))).......)))))).....))))))........((..((((...((((..((((.......))))..))))..)))).)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((.....)).))((({,,,({{(((,.(((((.(.((((((((.((((..((((((.(((((((.((((((((({(((,{{.((((((((.((((.((({...((((((.((....)).))))))..,}}}..{((((((((........)))),,)))|((((((..((((((..,(((((,..((((.{{,,{{.......{((((.((((((..(((..(((....)))..))))))))))))))..,,,,,,}}},}}))}}....}}}||||,|{{||,|{{(((((((.....(((((,..((..(((((((.(((((........)})))).)))))))..)}.},)))))......)))))))}{((((((......))))))|(((((.(((((((..((,((({..(((({,(,....}})))))}))).,),,.)))))))))))),...........{(((((((..(((((...{{(((...,,{(((...}}|||.....,...,,...........,,..||...{{{{.{{{{{{..,|||||||..(((((((((...))).)))))).........{{(...,|||,,,}}}}}|))||}}}.}}}}.,))....,||{{{{{{.||||,,.,))),.))))))),.,}}..,...))))}..))))}.))))))}}.))))))..)))))),...{{{.....,}|((((...((((.(((.((((.......((.((((.....)))).)).((((,((({((.,(.(({(({((.........{({.{{(((((,,(((....(((((.(((((,{((.....)))))))).))))))))))))))|{|{...}))}..,,},,}||,|,},,..,.})))}.)))))}..))))))}}))}),.)))).))).))))....)))),...}))}}}))))))..}).}}}......{{{{....,{({,,.|,.|||,,,|||,.....,}}}.,.{{{{.,....)))}.,,|.})))).)))).))))))).))..))))..)))).))))))).).).)))))..}},}})}}}}}}...{(((((((({.{{((({...,})}}},..,.((((((..,..(((((((((((((....)))))))..........(((.((((((((((....{((((..........))).))...))))))))))..))).......))))))..,..)))))).....,,,,{..({{{.||{(((..((((.......))))..)))),.)))).)}}))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.