Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0001800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087804 hsa_circABCA1_020
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107553203-107575003 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104790922-104812722 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-631.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -671.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 409.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((((((((.(((((((.....((((((((((((((((.((.((.((.((....((((..........))))..)).)).)))))))))....(((((((.((((((..((((((((.(((((......)))))(((((((((((((((((((..((((((...((((((((......(((.((((.(.(((((.(((((.....)))))......((((.((((....))))..)))).(((((........))))).....((((....))))(((((((.((((((((((((..(((.((((((......((((.((......((((((...(((.....(((...(((.((....))..)))))).....))).))))))...))))))))))))((.......)))))))))))....((((..((((.....))))..))))..(((((.((.(((((..........))))))))))))((((((.(..(........)..).))))))....))))))..)))))))((((((....)))))).......((((........((((((...(((....))).))).))).........)))).)))))...).)))).)))...)))))))))))))).....))...))).)))..)))))))))))...)))).))))))))))))))))).(((((((.....)))))))...(((((...........)))))......)))))))...................((((((((((...(((((((((((((((((...(((((((....)))))))))))..)).)))))))(((((.((((.....(((..((((.((((((......(((((((((.......)))))))))....(((((.(((.....))).)))))...)))))))))))))..((((......))))(((((((.((((.((.(((((((((.........)))........)))))).)).)).))..)))))))..((((((.(((...((((((........)))))).)))))))))))))...)))))...))))..))))))))))......(((((...)))))((((((..((...)).....))))))....))))....)))).))).))))).))).))))...)(((.((((((..((((((((((....)))).)))))).((((...))))..............(((((((((.......(((...(.((.((((((((...((((((((((.(((............)))))))))))))...((((....((((.(((.(((.(((((((((((.(((((((((.(((((((((((..((((((..((((((((((((.((((.((...((((..(((((((((.((((((....)).))))..)))))(((..((((....(((..(..(((((...)))))..)..)))...))))..)))........))))..))))...)).))))..))).)).).))))))...)))..)))..))))).)))..)))...)))))(((((((...((((((((((.(((......))))))..((.((((((..((((((((..(......)..))))))))..)))))).))......((((.(((...))).)))).........((((......)))).....)))))))..))))))).......)))).))))))....))))))))....))))))).....)))))))))))).)).)..)))(((((.....((((....))))..)))))........)))))))))((((..((((((((.(((..(((....))).)))((((((.((((.(...).))))))))))))))))))))))(((((..((((..(((......((.((((((.........)))))).)))))..)))).)))))...)))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..((((((((((((.(((((((.....(((((((,((((((((,({.{(.((.((....((((..........))))..)).)).)))))))))},|,(((((((.((((((..((((((((.(((((......)))))|((((((((((((((((,,.,((({((,,.((((((((,,,...{((.((((.({(((((.(((((.....))))).,,,,.((((.((({....})))..)))).,||||........))}}}....,((({,...}},|(((((((.(((((((((((,.,(((.((((((......((((.((......((((((...(((...,,{((,.,(({.((....))..)})))},},,}))).))))))...))))))))))))({.......}})))))))))....((((..((((.....))))..))))..(((((.(,{(((((..........)))))))))))){{{(((,(..,........,..).)))))),,,.))))))..)))))))|(((((....)))))),..................{||{{{,,.(((,,,,|}}.))),}))||.,,.....))).))}}),,.)})))).))),,.)))))))))),)))....,)),..)))},)}..)))))))))),...)))).))))))))))))))))),,,(((((({.,{||||||..,.((((,....}}}}...)},)),,.})))))).||,......}}}.........{(((((((((...((((((((((((({{,,..,(((((({....})))))))}}}..)).)))))))(((((.,,.......,|,,.{(((.((((((......(((((((((.......)))))))))....(((((.(((.....))).)))))...)))))))))}|||,,((((......))))(((((((.((((.{{.((((((,,,.........}))........}))))).}}.)).))..)))))))..((((({{(((...((((((,......,)))))).)))))))))))))}..)))))...))))..))))))))))..||.,{{(((,,,|}}},{{||||,,|,...}}.....}}}))).}))))))....)))).))).))))).))).))))...)(((.((((((..((((((((((....)))),}))))).((({...}))},..{{{.((((((.((((((...}))))}.(((...(.((.(((((((({.,({((((((((.(((............)))))))))))||,.........,((((.(((.(((.(((((((((((.((((.,{((.{{{((((((((..(,((((..((((((((((((.((((.((...((((..(((((((((.{(({((,...,),))),..)))))(((..{(({....{((..,..(((((...)))))..,..))}...))))..))}........))))..))))...)).))))..))).)).).))))))...)))}.},,..))))).)))..}))...}}|||(((((((.,.(((((((((,.,((...{{,||||,|{{(({((((((..((((((((.{{,,....)}}))))))))..))))),.,,......((({.(((...))).))))......}}}||||}}}}}},,))...}}))))))).,))))))).,,,,..)))).))))))....))))))))....))))))).....,))))))))))).)).,..))).|||,.....,{,|}},,}})}.)))))),,,...((((({(((.((((((((....).)))).))).))).((((((((({{((((({..{,..({(,((((({{{{{{{.{{{|,,,,.,,...}}}},},}}}},..,.,,.,.,|||}}}...})}},})))))))))))}})))))))))).)))))).)))
Forensic Context

No forensic context available.