Basic Information
Symbol
hsa_SMARCC1_0000800
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0123935
hsa_circSMARCC1_105
hsa-SMARCC1_0320
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47632151-47719801
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47590661-47678311
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-512.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-544.39 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
597.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((...(((((((((((((.((...((...((.(((...(((.....((((((..(((..((((((((((.(((((.((((..(.((.(((.((.(((...(((((((..(((((((((....)).))).))))..)))))))..))))).)))..)).)..))))...(((((....))))).)))))((((..((((.(((((...(((((....)))))...(((((..(((((((.....(((((((.(((...((((((((.(((...(((((...((.....(((((((..........)))))))..)))))))...))))))))..(((((((((.(...(((((.(((((.(....((((((((...........)))))))))))).)).)))))....).)).))))))).(((((((...((((((.(((((..(.(.((((((((...((..(..((((............(((((((.((...((((((....))))))........)).)))))))))))..)..))))).)))))).).)))))..))))))..((((((...))))))(((.....(((.((((((((..((((......((((.......))))..(((((((((((.((.((.(.((.((((...(((...(((((((((((....((.(((((....(((((((..(.(((((((..((.....)).)))).))).)..))))))).................))))).))....(((((((((...((((.......))))..))))))).)).))))))..))))))))))))))).)))))))))))))))))))..)).)))))).))).....)))..((.((((.....)))).)).((((....)))).........)))))))..)))....)))))))))).....))))))).))))).........))))))).))..))))))))).))))).(((((((............((((............))))............))))))).....................)))))))))))).))).))..)).)).)))))))))).))).......(((((.......)))))(((((((........)))))))......)))))).(((((((((..(((((.((............((((.((((((.(((((.((((....((....))....))))))))).....((((((....)))))).........)))))).))))..((((.......)))).......((((((.....((((((..(((....(((....((((....))))..((((..((..(((........)))))..))))...)))..))).))))))..((((((...((((...((((......)).))...))))..))))))..((.((....)).))...((((......(((.(((((...)))))...)))....))))..))))))..(((.(....).))).......)).)))))..)))))))))..........((((.(((........))).))))...(((((((.(((.(((.............))).))).....(((((((...))).)))).........(((((((((.......)))))))))......(((((..(.((((....))))...)..))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((({,,,..,......||||.,.,{{.....,,)}}.......))))).))((....{{{{...((({{(((((.((.(((((.{(,((((((({{((((({(({{((((((((,,{|||,...,{{{{{(((((({{{.(((((({....}))))))..(({.,{{,{.(((((....)))))...,,,||||,,|||{{,,,,....((({{.,,.}}}}},,.,,,,|||({{{{||,,.,||||{{{{|,{{...,,{|||||}|||}|}||,(({({(({{{,.(((((((..........)))))))..,,|||||.,,|}||}}},..{((({,,,,.,.|,|,{{{.{{{{,,|....{{||||{{,,{{{{{,.{{||||}||||||||.,.,,,|}{{{{{{||{||||,,,..,,,,||}}}|((((({(,((,{{.{(,{{{(((((.,{,{..{,,.((({,,{..|,,,,,(((((((.,,...((((((....))))))........,}.))))))),}},,.},.}}})}.))))),...})),,.})),)))}..|||||}}.|||,,.,,,},}..,,,.,|||||||..||{,....}}||||....}}}))),,}|||||||||||}||}||,||||}||||},,{{((({({{(((((.,{....}}}||,,{{(,{({({,{{|,|{((({{(({{((.{{,.||,|||,..||{|,,{|.||||{{{{||.,...||.|,.,{{|||||,.,,|||{{(({{...((((...}}}}},.,|||||||||{|{{|{{||..{{|,|||..,}|||||,,,,,}||,,,,,|||||,,..))))),,,,.)),.....)))..((.((((.....)))).)).((((....)))).........,||||,,.........,,|,,,}|||.....,))),,,.,,,.,...............{{........,},,.,,,(({.(((((((............((((............))))............)))))))..))).,.,.............((..((((...........))))..)).....{(((((...)))))){||||}.,.}}})))))|||||||}}}{{{,,,||||(({{...{|||{.....,|||||,..||||{.{,........}}..((((.((((((,(((({{((((....,,....}}....))))))))}.,...((((({....))))))...,,....)))))).)))).,(({{.......)))).......||}}||}.,..}})))}}.|}|..,,({.....((((,...)}},..((((..({.{(((........)))))..))))...}},..,,}}},,.||..((((((...((((...((((......)).))...))))..)))))).,||.|},..|}},},,,.,{||}....}|||,|||{|}.,)))))...))).}}}))).,})),}}}.,}}.,}.,}})}}))},,....,}.}}}}|,.,,|||}|||.....,}}.)))|,,))},,{{{{..{{{.,|||{...,,)}}}.}}}.,))))...,,,,.}}}))),}}},}},.(((((((...))).)))).........(((((((((.......))))))))).}}}}}}},))....))))).}).))))))))).}},..}..,.))
Forensic Context
No forensic context available.