Basic Information
Symbol
hsa_SMARCC1_0002300
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0123938
hsa_circSMARCC1_091
hsa-SMARCC1_0138
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47651556-47727660
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47610066-47686170
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-499.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-533.42 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
433.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.........))(((.....((.((((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((.(((((((..((((((((((...(((....(((((((.((((.....))))))))))))))...))))))))....))..)))))(((((((.....)))..)))).........(((((..............)))))((((.........))))..)).)))))...))))....))))))).)).......((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((....(((.(((.((((.......)))).))).)))((.((((..((((((((.((.(((.(((...(((..((((.(((((....)))))........)))))))))).)))...)))))))).))..))))))..((((....))))..)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))..)))))))))....).))))))))).))(((........)))...............(((((((((((.((((((...((((((........(((((((((((((.........))))))(((((((.((.((.(((((((((((...((..(..((((............(((((((.((...((((((....))))))........)).)))))))))))..)..))))).)))))..........))).))))..))))))).(((......))).......)))))))..........))))))....)))))).)))))))))..))..(((.((((((.......((((((((((((((.......)))))...((.((.((......((((..((((((.((.....(((...(((((.((.((((((((((.....((.((..(((((((....(((((((.....((((...))))....(((((.((((((((((((..(((.(((....((((((.....((.....(((((....))))).....))......)))..((.((((.....)))).)).((((....))))..........(((.........((........)).......)))........................((........))......(((.(((((((............((((............))))............)))))))..))).................((..((((...........))))..)).....((((((...))))))...)))...))))))))))))))))))(((.....)))(((...(((((......)))))...)))..........)))))..((((.((((((.(((((.((((....((....))....))))))))).....((((((....)))))).........)))))).))))..((((.......)))).......)))))))....)))))))..)).))(((.....(((((..(((....((((..((..(((........)))))..))))...((......))...((..((((((...((((...((((......)).))...))))..))))))..)).)))..)))))......)))....)))))))).)).)))))))))))).)))))).))))......)).)).))))))))))).......)))))).))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({.,,,.....}}{(({{,..((.((((((((((((((((((({{(((((((.{(((.(((((..((((((..((((((((((.,.(({...,(((((((.((((.....)))))))))))))).,.)))))))),...})..)))))}{{{{(((,,((,...{(((.........))))}))))},}}.......,,||,{{,{,,,......,,}),,,}.))))),,.)))}....))))))).}}.......((((((((.(((.(((((((((((((.{((((((((,..{(((.(((.((((,,....,)))),))).)))|(.((((..(((((((({{{.{{{,(((...(({.,((((.(((((....)))))......,,)))))))))}.}}}...}})))))).))..))))}.,.((((....)))).,)))))))))......)))))))))).)))..))}))).)))))..(((((((..........)))))))..)))))))}}.,..},})))))))).)),,.,,{{..{{{.|{,..,}..,...}}}|,{{(((((({.((((((.|{((((((......,,(((((({((((((.........))))))(((((((.((.((.(({{{{({{({.,{,{..{,,.(({{,,{..|,|,,,(((((((.,,...((((((....))))))........,}.))))))),}},,.},.}},)},)}))),...,}},,.))).))))..))))))).(({......))).......}}))))).,}}......)))))}.,,.)))))).}))))))))||||..{((.((((((.......((((((((((((((..,....))}}}..,{(,((,{{.,||,,((((..((((((.((,.,,.{{{...{{(({{((.((((((((((.{...((.({..(((((((....(((((((,{,..((((...}}}}},,}{{|||.((((((((((((..(((.(((....((((({.,...((.....(((((....))))).....))......)))..((.((((.....)))).)).((((....))))..........{({,.........{........||{......)))........................{{........}}...,,.(((.(((((((............((((............))))............)))))))..))).},,.............((..((((...........))))..)).....((((((...)))))).,,})),,.))))))))))))))))))|||.,.,{||((((,..(((((......)))))...|}||,.,.........}}..{|||.||||||,{((({{((((....,,....}}....))))))))}.....((((({....)))))).,,},....}}}}}}.)}}}.,(({{.......)))).......)))))))....))))))).,)).}){((.....(((({..{||,...((((..({.{(((........)))))..))))...||.....,}....{(..((((((...((((...((((......)).))...))))..))))))..)).|}}..}))}}..,..,)))....)))))))).)).))))))}}}))).)))))).))))...,,,)).}),,)))))))))).......)))))).))).}))
Forensic Context
No forensic context available.